结直肠癌细胞进化TugHall模拟数据集
TugHall结直肠癌细胞进化数据集包含数百万次癌细胞演化模拟结果及关键基因变异频率，属于结构化表格数据，主要用于癌症克隆异质性研究、演化建模、参数推断和统计方法验证。
基本信息
资源简介
该数据集包含基于tugHall模拟器生成的数百万次结直肠癌细胞进化过程的仿真结果，用于研究癌症克隆异质性和基因进化动态。数据涵盖四个关键基因（APC、KRAS、TP53、PIK3CA）的变异等位基因频率，反映肿瘤进化终点的遗传特征。通过整合基因组与癌症表型的关联矩阵驱动随机模拟，支持个性化参数推断。适用于近似贝叶斯计算等统计方法，助力癌症演化建模与个体化医疗研究。数据规模大、重复性强，适用于计算生物学和癌症进化分析。
下载信息
注册下载
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暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载，应该可以免费公开下载。
免登录有偿下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
git clone https://github.com/tugHall/Dataset.git
curl -L -o repo.zip https://github.com/tugHall/Dataset/archive/refs/heads/master.zip
unzip repo.zip
数据集大小约 0.30 GB。
源站 README 摘录（使用方式）
Dataset of tugHall simulations for colorectal cancer
The folders have README files and content subdatasets.
The full dataset is published at mendeley.com: http://dx.doi.org/10.17632/spszxd8r3z.1
Please, cite as follow:
Nagornov, Iurii; Nishino, Jo; Kato, Mamoru (2020), “Dataset of tugHall simulations of cell evolution for colorectal cancer ”, Mendeley Data, V1, https://doi.org/10.17632/spszxd8r3z.1
Iurii Nagornov, Jo Nishino, Mamoru Kato, Dataset of tugHall simulations of cell evolution for colorectal cancer, Data in Brief, Vol. 34, February 2021, 106719. https://doi.org/10.1016/j.dib.2021.106719
Description of dataset is in the folder Description and in the paper.
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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