单细胞RNA测序数据集|结直肠癌数据集
结直肠癌单细胞RNA测序数据集包含肿瘤及邻近组织细胞的基因表达矩阵和精细细胞类型注释，属于表格数据，主要用于细胞类型识别、肿瘤微环境解析、免疫浸润研究和标志物发现。
基本信息
资源简介
单细胞RNA测序数据集 结直肠癌数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《CRC_scRNAseq》。源站首次发布：2022-08-23。
【数据内容】
源站原始描述：Data matrix and metafiles for CRC scRNAseq.rds.gz: A total of 54,103 cell transcriptomes from 5 colorectal cancer patients of which 29,481 cells originated from tumors and 24,622 cells from adjacent non-malignant tissues. The file is the Seurat object list which includes the expression matrix and annotation of 58 cell types. CellRanger_Output: Sequenced reads were then mapped to GRCh38 whole genome using 10X Genomics'' Cell Ranger 3 software''s cell ranger count function. This compressed file incl…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 1.37 GB。数据集 DOI：10.17632/pkfvr43s83.1。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/pkfvr43s83
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/pkfvr43s83
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 1.27 GB。
数据说明
Single-Cell RNA Sequencing Dataset
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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