单细胞RNA测序数据集|结直肠癌数据集
结直肠癌单细胞RNA测序数据集包含肿瘤及邻近组织细胞的基因表达矩阵和精细细胞类型注释，属于表格数据，主要用于细胞类型识别、肿瘤微环境解析、免疫浸润研究和标志物发现。
基本信息
模态
表格
大小
1.27 GB
数据量
54103
任务类型
细胞类型注释
许可
CC-BY-4.0
创建/更新时间
2025-12-22
资源简介
该数据集包含5位结直肠癌患者的54,103个细胞的单细胞转录组数据，其中29,481个来自肿瘤组织，24,622个来自相邻非恶性组织。数据以Seurat对象形式提供，包含基因表达矩阵和58种精细注释的细胞类型，同时附带Cell Ranger 3处理后的原始过滤矩阵。数据集规模大、细胞类型丰富，适用于肿瘤微环境解析、免疫细胞浸润研究及癌症特异性生物标志物发现等场景。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后，才能进行数据下载，注册有对应要求，或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载，应该可以免费公开下载。
暂未开放有偿下载
Tips: 该数据集 Qianfanghub 可以协助提供有偿下载服务，注意，服务不针对数据相关产权，只是技术服务费。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/pkfvr43s83
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 1.27 GB。
数据说明
Single-Cell RNA Sequencing Dataset
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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