结直肠癌药物反应测试数据集

结直肠癌药物反应测试数据集包含患者来源类器官在不同药物、浓度和时间点下的蛋白表达及翻译后修饰信息,属于表格数据,主要用于药物反应预测、生物标志物发现和精准医疗研究。

英国伦敦大学学院UCL英国伦敦大学学院UCL
Kaggle
2025-12-22 更新
浏览 9
表格药物反应预测

基本信息

模态
表格
大小
0.15 GB
数据量
619666
任务类型
药物反应预测
许可
CC-BY-NC-SA-3.0
创建/更新时间
2025-12-22

资源简介

Trellis CRC PDO-CAF Screen on PDO 21 结直肠癌药物反应测试数据集来自公开Kaggle平台,包含结直肠癌患者来源类器官(PDO)在不同药物处理下的蛋白质翻译后修饰(PTM)及蛋白表达数据。数据集涵盖多个批次、时间点、药物浓度及样本培养方式的元信息,规模较大且结构清晰。其主要特点为高维度分子响应数据与详细的实验元数据结合,适用于药物反应预测、生物标志物发现等场景,可支持结直肠癌精准医疗研究及医疗大模型训练。

原始链接

https://www.kaggle.com/datasets/mariaramosz/trellis-pdo21-pdo-caf-screen

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使用方式

数据集获取

方式一:KaggleHub(Python,推荐 AI Agent 使用)

# 前置依赖: pip install kagglehub
import kagglehub

path = kagglehub.dataset_download("mariaramosz/trellis-pdo21-pdo-caf-screen")
print("数据已下载至:", path)

方式二:Kaggle CLI(命令行)

# 前置条件: 注册 Kaggle 账号, Settings > API > Create New Token
# 将 kaggle.json 放到 ~/.kaggle/ 并 chmod 600
pip install kaggle
kaggle datasets download -d mariaramosz/trellis-pdo21-pdo-caf-screen
unzip trellis-pdo21-pdo-caf-screen.zip -d trellis-pdo21-pdo-caf-screen/

数据集大小约 0.15 GB

数据说明

Trellis CRC PDO-CAF Screen on PDO 21 结直肠癌药物反应测试数据集来自公开Kaggle平台,包含结直肠癌患者来源类器官(PDO)在不同药物处理下的蛋白质翻译后修饰(PTM)及蛋白表达数据。数据集涵盖多个批次、时间点、药物浓度及样本培养方式的元信息,规模较大且结构清晰。其主要特点为高维度分子响应数据与详细的实验元数据结合,适用于药物反应预测、生物标志物发现等场景,可支持结直肠癌精准医疗研究及医疗大模型训练。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

许可

CC-BY-NC-SA-3.0

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