2017-2019年北京大麦叶通过改善肠道微生物依赖的粘液屏障功能预防结肠炎研究数据库

该数据集为小鼠实验数据,包含饲料、肠道微生物、代谢组、炎症因子、转录组等多模态数据,主要研究大麦叶通过调节肠道微生物和PPARγ信号通路改善粘液屏障功能以预防结肠炎的机制,适用于肠道微生物与结肠炎相互作用、营养干预及炎症性肠病预防等研究方向。

中国农业大学中国农业大学
国家农业科学数据中心
2021-10-15 更新
浏览 23
大麦叶结肠炎肠道微生物屏障功能小鼠转录组代谢组短链脂肪酸
2017-2019 Beijing Barley Leaf Prevention of Colitis via Improving Gut Microbiota-Dependent Mucosal Barrier Function Research Database

基本信息

创建/更新时间
2021-10-15

资源简介

2017-2019年北京大麦叶通过改善肠道微生物依赖的粘液屏障功能预防结肠炎研究数据库

【一句话概览】

该数据库汇集2017至2019年北京大麦叶通过改善肠道微生物依赖的粘液屏障功能预防结肠炎的小鼠实验数据,涵盖饲料组成、营养成分、肠道微生物组成、短链脂肪酸、细菌拷贝数、代谢组、芳香族代谢物、体重变化、疾病活动指数、结肠长度、炎症因子、组织学分数、结肠隐窝高度、转录组及基因表达等指标,主要涉及大麦叶促进纤维降解细菌生长及芳香族代谢物产生、抑制DSS诱导的结肠炎及肠道菌群失调、通过PPARγ信号改善结肠粘液屏障功能、肠道微生物参与PPARγ信号通路激活及抗结肠炎作用四方面内容(来源 agridata.cn)。

【数据内容】

源站原始描述:小鼠实验数据结果。含有小鼠饲料组成、营养成分分析、肠道微生物组成、短链脂肪酸含量、细菌拷贝数、代谢组、芳香族代谢物含量、小鼠体重变化、疾病活动指数、结肠长度、炎症因子水平、组织学分数、结肠隐窝高度、转录组、基因表达水平等数据,主要包括大麦叶促进纤维降解细菌生长及芳香族代谢物产生、大麦叶抑制DSS诱导的结肠炎及肠道菌群失调、大麦叶通过PPARγ信号改善结肠粘液屏障功能、肠道微生物参与PPARγ信号通路激活及抗结肠炎作用四个方面内容

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):Mouse experimental data results. Contains data on mouse diet composition, nutrient composition analysis, gut microbiota composition, short-chain fatty acid content, bacterial copy number, metabolomics, aromatic metabolite content, mouse body weight changes, disease activity index, colon length, inflammatory factor levels, histological scores, colonic crypt height, transcriptomics, gene expression levels, etc., mainly including four aspects: barley leaf promotes the growth of fiber-degrading bacteria and the production of aromatic metabolites, barley leaf inhibits DSS-induced colitis and gut microbiota dysbiosis, barley leaf improves colonic mucus barrier function through PPARγ signaling, and gut microbiota participates in PPARγ signaling pathway activation and anti-colitis effects.

【主题与分类】

主题标签:大麦叶、结肠炎、肠道微生物、屏障功能、小鼠、转录组、代谢组、短链脂肪酸。

【获取与许可】

源站页面:https://www.agridata.cn/data.html#/datadetail?id=289033

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源站:https://www.agridata.cn/data.html#/datadetail?id=289033

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集为一项小鼠实验研究数据库,旨在探究大麦叶对结肠炎的预防作用及其机制。数据集包含小鼠饲料组成、营养成分分析、肠道微生物组成、短链脂肪酸含量、细菌拷贝数、代谢组、芳香族代谢物含量、小鼠体重变化、疾病活动指数、结肠长度、炎症因子水平、组织学分数、结肠隐窝高度、转录组及基因表达水平等多维度数据。研究内容主要涵盖大麦叶促进纤维降解细菌生长及芳香族代谢物产生、抑制DSS诱导的结肠炎及肠道菌群失调、通过PPARγ信号改善结肠粘液屏障功能,以及肠道微生物参与PPARγ信号通路激活及抗结肠炎作用四个方面。数据来源于中国农业大学的研究,适用于肠道微生物与结肠炎相互作用、营养干预与肠道屏障功能、以及炎症性肠病预防机制等研究方向。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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