2017-2019年北京大麦叶通过改善肠道微生物依赖的粘液屏障功能预防结肠炎研究数据库

该数据集为小鼠实验数据,包含饲料、肠道微生物、代谢组、炎症因子、转录组等多模态数据,主要研究大麦叶通过调节肠道微生物和PPARγ信号通路改善粘液屏障功能以预防结肠炎的机制,适用于肠道微生物与结肠炎相互作用、营养干预及炎症性肠病预防等研究方向。

中国农业大学中国农业大学
国家农业科学数据中心
2021-10-15 更新
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肠道微生物结肠炎预防

基本信息

创建/更新时间
2021-10-15

资源简介

该数据集为一项小鼠实验研究数据库,旨在探究大麦叶对结肠炎的预防作用及其机制。数据集包含小鼠饲料组成、营养成分分析、肠道微生物组成、短链脂肪酸含量、细菌拷贝数、代谢组、芳香族代谢物含量、小鼠体重变化、疾病活动指数、结肠长度、炎症因子水平、组织学分数、结肠隐窝高度、转录组及基因表达水平等多维度数据。研究内容主要涵盖大麦叶促进纤维降解细菌生长及芳香族代谢物产生、抑制DSS诱导的结肠炎及肠道菌群失调、通过PPARγ信号改善结肠粘液屏障功能,以及肠道微生物参与PPARγ信号通路激活及抗结肠炎作用四个方面。数据来源于中国农业大学的研究,适用于肠道微生物与结肠炎相互作用、营养干预与肠道屏障功能、以及炎症性肠病预防机制等研究方向。

原始链接

https://www.agridata.cn/data.html#/datadetail?id=289033

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数据说明

该数据集为一项小鼠实验研究数据库,旨在探究大麦叶对结肠炎的预防作用及其机制。数据集包含小鼠饲料组成、营养成分分析、肠道微生物组成、短链脂肪酸含量、细菌拷贝数、代谢组、芳香族代谢物含量、小鼠体重变化、疾病活动指数、结肠长度、炎症因子水平、组织学分数、结肠隐窝高度、转录组及基因表达水平等多维度数据。研究内容主要涵盖大麦叶促进纤维降解细菌生长及芳香族代谢物产生、抑制DSS诱导的结肠炎及肠道菌群失调、通过PPARγ信号改善结肠粘液屏障功能,以及肠道微生物参与PPARγ信号通路激活及抗结肠炎作用四个方面。数据来源于中国农业大学的研究,适用于肠道微生物与结肠炎相互作用、营养干预与肠道屏障功能、以及炎症性肠病预防机制等研究方向。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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