1型血管性血友病内皮集落形成细胞基础与刺激状态下VWF释放的转录组分析

该数据集来自 data.mendeley.com，包含 26 个文件，涉及 1 型血管性血友病（Type 1 VWD）患者来源的内皮集落形成细胞在基础与刺激状态下 von Willebrand factor 释放的转录组分析

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2022-09-20 更新

基因组回归血管性血友病内皮集落形成细胞转录组VWF释放mRNA-SeqType 1 VWD

Transcriptome analysis of basal and stimulated von Willebrand factor release from endothelial colony forming cells derived from Type 1 von Willebrand disease patients

基本信息

模态

基因组

大小

0.010008081 GB

任务类型

回归

创建/更新时间

2022-09-20

版本

资源简介

1型血管性血友病内皮集落形成细胞基础与刺激状态下VWF释放的转录组分析

Transcriptome analysis of basal and stimulated von Willebrand factor release from endothelial colony forming cells derived from Type 1 von Willebrand disease patients

该数据集来自 data.mendeley.com，包含 26 个文件，涉及 1 型血管性血友病（Type 1 VWD）患者来源的内皮集落形成细胞在基础与刺激状态下 von Willebrand factor 释放的转录组分析。样本来自加拿大 Kingston 东南安大略遗传性出血性疾病门诊招募的成年患者，纳入标准包括 VWF 抗原和/或活性水平在 0.05 至 0.50 IU/mL 之间、VWF:GPIbM/VWF:Ag 比值大于 0.6 且 VWF 多聚体正常。数据包含 miRNA 处理结果及多个样本的 counts 文件，可用于研究 VWD 相关基因表达与 VWF 释放调控机制（来源 Mendeley Data）。

【数据集背景】

源站首次发布：2022-09-20。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：所有参与者均提供了知情同意，本研究获得了 Queen’s University Health Sciences Ethics Review Board 的批准。通过位于加拿大 Kingston 的东南安大略遗传性出血性疾病门诊招募了年龄≥18 岁的 Type 1 VWD 患者。Type 1 VWD 患者的纳入标准包括 VWF 抗原（VWF:Ag）和/或 VWF 活性（VWF:GPIbM 或 VWF:RCo）水平在 0.05 至 0.50 IU/mL 之间，VWF:GPIbM/VWF:Ag 比值>0.6，且 VWF 多聚体正常。使用 350ng 总 RNA 作为输入，通过 QuantSeq 3’ mRNA-Seq Library Prep Kit（Lexogen，奥地利）构建 Illumina 兼容文库。文库大小和浓度分别使用 Labchip GX（Perkin Elmer）和 Qubit（Thermo Fisher）平台测定。独立索引并纯化的文库以等摩尔浓度混合，文库池进行

【数据结构与技术规格】

文件数 26 个，合计 10.01 MB。数据集 DOI：10.17632/jc2vnrsccw.1。

【主题与分类】

主题标签：血管性血友病、内皮集落形成细胞、转录组、VWF释放、mRNA-Seq、Type 1 VWD。本站分类：消化系统疾病。

【获取与许可】

源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/jc2vnrsccw

原始链接

https://data.mendeley.com/datasets/jc2vnrsccw

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源站：https://data.mendeley.com/datasets/jc2vnrsccw

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 10.0 MB。

数据说明

Charles Hindmarch (2022). Transcriptome analysis of basal and stimulated von Willebrand factor release from endothelial colony forming cells derived from Type 1 von Willebrand disease patients [Dataset]. http://doi.org/10.17632/jc2vnrsccw.1

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别