二甲双胍重塑肠道菌群来源γ-氨基丁酸通过抑制铁死亡减轻肝脏缺血再灌注损伤

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A904cfef01654c8d3a24e583aff849770498c1f5e6fd0b29c05bd9648117d48d0

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肝脏缺血/再灌注损伤（HIRI）是导致多种肝病预后不良的常见且不可避免的因素，使得目前临床治疗效果不尽如人意。近年研究表明，二甲双胍对减轻HIRI具有益处，然而其潜在机制仍不清楚。本研究发现，二甲双胍通过重塑小鼠肠道菌群减轻HIRI诱导的铁死亡，粪菌移植治疗结果证实了这一点，但当使用抗生素清除肠道细菌后，其有益效应消失。具体而言，通过16S rRNA和宏基因组测序，我们发现二甲双胍重塑的菌群特征为产生γ-氨基丁酸（GABA）的细菌增加。这一增加进一步通过肠道微生物中GABA合成关键酶——谷氨酸脱羧酶和腐胺氨基转移酶——的升高得到证实，…, , , # 二甲双胍治疗产生的肠道菌群来源γ-氨基丁酸通过抑制铁死亡减轻肝脏缺血/再灌注损伤 ## I.

数据集概述 本数据集包含eLife文章中使用的原始数据，主要支持肝脏缺血再灌注损伤的研究。数据集包含多种类型的数据文件，包括但不限于文本文件、图像文件和分析代码。 # II. 文件结构与命名规范 数据文件根据其在稿件中的位置组织到单独的文件夹中，例如“图1数据”、“图2数据”等。 ## III. 数据内容 文本数据：包含实验测量值、统计结果等。所有数据均放在Excel文档中，命名如“原始数据（图1数据）”，位于“图1数据”文件夹等。 图像数据：包括实验图像、显微照片等，以TIFF或JPG格式存储。 缩略语含义：ALT和AST指谷丙转氨

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。