GSE272583：8号染色体三体相关自身炎症性疾病（TRIAD）的深度免疫学分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272583

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

8号染色体三体嵌合是一种细胞遗传学异常，常见于血液系统恶性肿瘤，但也与炎症性疾病相关。我们对无恶性肿瘤但伴有炎症症状的8号染色体三体嵌合个体进行了特征分析。受试者在儿童期表现为反复发热以及口腔、生殖器和胃肠道溃疡。我们建议将这种独特的自身炎症性疾病称为8号染色体三体相关自身炎症性疾病，简称TRIAD。对6名患有8号染色体三体并伴炎症性疾病的受试者和3名健康对照进行CITE-seq，显示经典CD14+单核细胞扩增，并具有IL-1b和1型IFN特征。我们利用8号染色体上基因的表达水平，在8号染色体三体受试者中识别出三体细胞和二体细胞。我们发现，髓系细胞中8号染色体三体细胞比例高，且与健康对照相比，三体CD14+单核细胞中I型IFN、II型IFN和IL-1b信号通路的表达更高。然而，在淋巴细胞中，初始T淋巴细胞中8号染色体三体细胞水平高，而对应的效应/记忆T淋巴细胞中水平低。与二体细胞和健康对照相比，8号染色体三体记忆CD8+ T细胞的细胞毒性基因表达较低。与未扩增克隆相比，扩增的CD8+记忆T细胞克隆中8号染色体三体细胞显著更少。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。