冠状动脉疾病生物标志物计算组学方法研究支持数据
该数据集是一个多模态生物医学研究数据集,包含代谢组学、脂质组学、蛋白质组学和单细胞转录组(CITE-seq)数据,主要针对冠状动脉疾病的生物标志物发现研究,通过整合小鼠模型和人类临床样本(包括斑块组织、血浆蛋白和PBMC细胞),利用计算组学方法进行数据分析和处理,为心血管疾病的机制探索和诊断工具开发提供支持。
基本信息
资源简介
该数据集是一个用于冠状动脉疾病(CAD)生物标志物发现的多组学研究支持数据集,包含代谢组学、脂质组学和蛋白质组学分析数据。具体包括:1)使用33只小鼠进行代谢组学和脂质组学分析,通过Multi-ABLE方法收集斑块组织,并利用multi-ABLE流程处理数据;2)基于BioHEART研究的1004个样本进行蛋白质组学分析,通过LC-MS技术收集血浆蛋白,并使用DIA-NN处理原始数据;3)基于BioHEART研究的51个样本进行CITE-seq分析,收集外周血单个核细胞(PBMC),并使用scClassify和Seurat进行数据处理和注释。数据集提供了输入数据、处理后数据以及相关分析代码,主要应用于CAD的生物标志物发现、计算组学方法验证和疾病机制研究。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后,才能进行数据下载,注册有对应要求,或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载,应该可以免费公开下载。
暂未开放有偿下载
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个用于冠状动脉疾病(CAD)生物标志物发现的多组学研究支持数据集,包含代谢组学、脂质组学和蛋白质组学分析数据。具体包括:1)使用33只小鼠进行代谢组学和脂质组学分析,通过Multi-ABLE方法收集斑块组织,并利用multi-ABLE流程处理数据;2)基于BioHEART研究的1004个样本进行蛋白质组学分析,通过LC-MS技术收集血浆蛋白,并使用DIA-NN处理原始数据;3)基于BioHEART研究的51个样本进行CITE-seq分析,收集外周血单个核细胞(PBMC),并使用scClassify和Seurat进行数据处理和注释。数据集提供了输入数据、处理后数据以及相关分析代码,主要应用于CAD的生物标志物发现、计算组学方法验证和疾病机制研究。
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