冠状动脉疾病生物标志物计算组学方法研究支持数据
该数据集是一个多模态生物医学研究数据集，包含代谢组学、脂质组学、蛋白质组学和单细胞转录组（CITE-seq）数据，主要针对冠状动脉疾病的生物标志物发现研究，通过整合小鼠模型和人类临床样本（包括斑块组织、血浆蛋白和PBMC细胞），利用计算组学方法进行数据分析和处理，为心血管疾病的机制探索和诊断工具开发提供支持。
更新时间2024-05-21
原始链接
https://datahub.hku.hk/articles/dataset/Supporting_data_for_Coronary_artery_disease_biomarker_discovery_using_computational_omics_approaches_/25721457/1
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资源简介
该数据集是一个用于冠状动脉疾病（CAD）生物标志物发现的多组学研究支持数据集，包含代谢组学、脂质组学和蛋白质组学分析数据。具体包括：1）使用33只小鼠进行代谢组学和脂质组学分析，通过Multi-ABLE方法收集斑块组织，并利用multi-ABLE流程处理数据；2）基于BioHEART研究的1004个样本进行蛋白质组学分析，通过LC-MS技术收集血浆蛋白，并使用DIA-NN处理原始数据；3）基于BioHEART研究的51个样本进行CITE-seq分析，收集外周血单个核细胞（PBMC），并使用scClassify和Seurat进行数据处理和注释。数据集提供了输入数据、处理后数据以及相关分析代码，主要应用于CAD的生物标志物发现、计算组学方法验证和疾病机制研究。
提供机构：HKU Data Repository
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