冠状动脉疾病生物标志物计算组学方法研究支持数据

该数据集是一个多模态生物医学研究数据集,包含代谢组学、脂质组学、蛋白质组学和单细胞转录组(CITE-seq)数据,主要针对冠状动脉疾病的生物标志物发现研究,通过整合小鼠模型和人类临床样本(包括斑块组织、血浆蛋白和PBMC细胞),利用计算组学方法进行数据分析和处理,为心血管疾病的机制探索和诊断工具开发提供支持。

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2024-05-21 更新
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冠状动脉疾病生物信息学

基本信息

创建/更新时间
2024-05-21

资源简介

该数据集是一个用于冠状动脉疾病(CAD)生物标志物发现的多组学研究支持数据集,包含代谢组学、脂质组学和蛋白质组学分析数据。具体包括:1)使用33只小鼠进行代谢组学和脂质组学分析,通过Multi-ABLE方法收集斑块组织,并利用multi-ABLE流程处理数据;2)基于BioHEART研究的1004个样本进行蛋白质组学分析,通过LC-MS技术收集血浆蛋白,并使用DIA-NN处理原始数据;3)基于BioHEART研究的51个样本进行CITE-seq分析,收集外周血单个核细胞(PBMC),并使用scClassify和Seurat进行数据处理和注释。数据集提供了输入数据、处理后数据以及相关分析代码,主要应用于CAD的生物标志物发现、计算组学方法验证和疾病机制研究。

原始链接

https://datahub.hku.hk/articles/dataset/Supporting_data_for_Coronary_artery_disease_biomarker_discovery_using_computational_omics_approaches_/25721457/1

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数据说明

该数据集是一个用于冠状动脉疾病(CAD)生物标志物发现的多组学研究支持数据集,包含代谢组学、脂质组学和蛋白质组学分析数据。具体包括:1)使用33只小鼠进行代谢组学和脂质组学分析,通过Multi-ABLE方法收集斑块组织,并利用multi-ABLE流程处理数据;2)基于BioHEART研究的1004个样本进行蛋白质组学分析,通过LC-MS技术收集血浆蛋白,并使用DIA-NN处理原始数据;3)基于BioHEART研究的51个样本进行CITE-seq分析,收集外周血单个核细胞(PBMC),并使用scClassify和Seurat进行数据处理和注释。数据集提供了输入数据、处理后数据以及相关分析代码,主要应用于CAD的生物标志物发现、计算组学方法验证和疾病机制研究。

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