冠状动脉疾病生物标志物计算组学方法研究支持数据
该数据集是一个多模态生物医学研究数据集，包含代谢组学、脂质组学、蛋白质组学和单细胞转录组（CITE-seq）数据，主要针对冠状动脉疾病的生物标志物发现研究，通过整合小鼠模型和人类临床样本（包括斑块组织、血浆蛋白和PBMC细胞），利用计算组学方法进行数据分析和处理，为心血管疾病的机制探索和诊断工具开发提供支持。
基本信息
资源简介
冠状动脉疾病生物标志物计算组学方法研究支持数据
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Supporting data for "Coronary artery disease biomarker discovery using computational omics approaches"》。源站首次发布：2024-05-21。
【数据内容】
源站原始描述：- Metabolomic and lipidomic analysis in CAD using 33 mice. Plaque tissue were collected using the Multi-ABLE method and was analysed and processed using the multi-ABLE pipeline. Uploaded data includes the input data for multi-ABLE, processed data and the code to processed the data. Full data and methodology is published at - Proteomic analysis in CAD using 1004 samples. Plasma proteins were collected under the BioHEART study and is analysed using LC-MS. DIA-NN is used to process the LC-MS raw da…
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.25442/hku.25721457.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Other biomedical and clinical sciences not elsewhere classified。主题标签：Proteomic、Metabolomic、Lipidomic、CITE-seq、CAD。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Other biomedical and clinical sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://datahub.hku.hk/articles/dataset/Supporting_data_for_Coronary_artery_disease_biomarker_discovery_using_computational_omics_approaches_/25721457
使用许可：CC BY-NC 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/）。
规范引用：Lee, Chun Hin (2024). Supporting data for "Coronary artery disease biomarker discovery using computational omics approaches". HKU DataHub. Dataset
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个用于冠状动脉疾病（CAD）生物标志物发现的多组学研究支持数据集，包含代谢组学、脂质组学和蛋白质组学分析数据。具体包括：1）使用33只小鼠进行代谢组学和脂质组学分析，通过Multi-ABLE方法收集斑块组织，并利用multi-ABLE流程处理数据；2）基于BioHEART研究的1004个样本进行蛋白质组学分析，通过LC-MS技术收集血浆蛋白，并使用DIA-NN处理原始数据；3）基于BioHEART研究的51个样本进行CITE-seq分析，收集外周血单个核细胞（PBMC），并使用scClassify和Seurat进行数据处理和注释。数据集提供了输入数据、处理后数据以及相关分析代码，主要应用于CAD的生物标志物发现、计算组学方法验证和疾病机制研究。
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