贲门失弛缓症患者与健康对照的HLA-DRB1/-DQB1单倍型频率
该数据集来自 plos.figshare.com，包含墨西哥混血人群贲门失弛缓症患者与健康对照的 HLA-DRB1/-DQB1 单倍型频率数据，共 5 个文件
基本信息
资源简介
贲门失弛缓症患者与健康对照的HLA-DRB1/-DQB1单倍型频率
An original Eurasian haplotype, HLA-DRB114:54-DQB105:03, influences the susceptibility to idiopathic achalasia
该数据集来自 plos.figshare.com，包含墨西哥混血人群贲门失弛缓症患者与健康对照的 HLA-DRB1/-DQB1 单倍型频率数据，共 5 个文件。研究基于 Sanger 和下一代测序技术进行高分辨率 HLA 分型，分析 HLA 等位基因与保守扩展单倍型，并采用非参数统计与 Bonferroni 校正。数据可用于探索 HLA II 类等位基因及扩展单倍型与特发性贲门失弛缓症易感性的关联，支持免疫遗传学与消化道运动障碍研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《An original Eurasian haplotype, HLA-DRB114:54-DQB105:03, influences the susceptibility to idiopathic achalasia》发表于 PLOS ONE（2018），DOI：10.1371/journal.pone.0201676。源站首次发布：2018-08-09。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：特发性贲门失弛缓症是一种相对罕见食管运动障碍，主要组织相容性复合体（MHC）基因是其已明确识别的风险因素。然而，此前尚无关于墨西哥人群 HLA-贲门失弛缓症易感性的报道。我们研究了 91 名确诊贲门失弛缓症患者和 234 名具有墨西哥混合血统的健康对照。使用基于 Sanger 和下一代测序技术的高分辨率 HLA 分型分析 HLA 等位基因和保守扩展单倍型。使用 HLA-B 和短串联重复序列确定混合估计。结果通过非参数统计分析和 Bonferroni 校正进行分析。与对照组相比，贲门失弛缓症组中发现 P 值 pC<0.05）。总之，HLA II 类等位基因 HLA-DRB114:54:01 和 DQB105:03:01 以及扩展单倍型是风险因素
【数据结构与技术规格】
文件数 5 个，合计 2.61 MB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0201676。
【主题与分类】
源站学科分类：Genetics、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified、Mathematical Sciences not elsewhere classified。主题标签：DRB、allele、next-generation sequencing technologies、DQB、HLA-B、Bonferroni correction、MHC、HLA、haplotype、esophageal motor disorder。本站分类：消化系统疾病/贲门失弛缓症。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Genetics、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified、Mathematical Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/An_original_Eurasian_haplotype_HLA-DRB1_14_54-DQB1_05_03_influences_the_susceptibility_to_idiopathic_achalasia/6951467
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Furuzawa-Carballeda, Janette; Zuñiga, Joaquín; Hernández-Zaragoza, Diana I.; Barquera, Rodrigo; Marques-García, Eduardo; Jiménez-Alvarez, Luis; et al. (2018). An original Eurasian haplotype, HLA-DRB114:54-DQB105:03, influences the susceptibility to idiopathic achalasia. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-30，引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：An original Eurasian haplotype, HLA-DRB114:54-DQB105:03, influences the susceptibility to idiopathic achalasia
- DOI：10.1371/journal.pone.0201676
- 发布日期：2018-08-09
- 文件数：5 个
- 文件总体积：2.61 MB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/An_original_Eurasian_haplotype_HLA-DRB1_14_54-DQB1_05_03_influences_the_susceptibility_to_idiopathic_achalasia/6951467
命令行下载
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文件清单
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文件总体积 2.61 MB（源站 API 实测）。
数据说明
特发性贲门失弛缓症是一种相对少见的食管运动障碍，其主要组织相容性复合体（MHC）基因是已明确识别的风险因素。然而，此前尚无关于墨西哥人群HLA-贲门失弛缓症易感性的报道。我们研究了一组91名确诊为贲门失弛缓症的患者和234名具有墨西哥混合血统的健康对照者。采用基于Sanger测序和下一代测序技术的高分辨率HLA分型，分析了HLA等位基因和保守延伸单倍型。使用HLA-B和短串联重复序列确定混合血统估计值。结果通过非参数统计分析和Bonferroni校正进行分析。与对照组相比，贲门失弛缓症组中发现了P值pC<0.05的差异。总之，HLA II类等位基因HLA-DRB114:54:01和DQB105:03:01以及延伸单倍型是混合血统墨西哥个体中贲门失弛缓症的风险因素。这些结果还表明，HLA-DRB114:54-DQB105:03单倍型是通过与欧洲和/或亚洲人群的混合而引入的。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0201676（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/An_original_Eurasian_haplotype_HLA-DRB1_14_54-DQB1_05_03_influences_the_susceptibility_to_idiopathic_achalasia/6951467）。
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