超越MHC：犬皮肌炎模型揭示涉及新位点的复杂遗传风险模式
该数据集是一个关于犬类皮肌炎遗传风险的基因组数据集，包含通过全基因组关联研究和重测序获得的犬类MHC单倍型、PAN2基因和MAP3K7CL基因的遗传变异数据，主要用于研究复杂自身免疫性疾病的遗传机制、上位性效应及基因型-表型关联，为人类幼年型皮肌炎的遗传学研究提供动物模型参考和潜在分子靶点。
基本信息
资源简介
超越MHC：犬皮肌炎模型揭示涉及新位点的复杂遗传风险模式
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Beyond the MHC: A canine model of dermatomyositis shows a complex pattern of genetic risk involving novel loci》。配套论文《Beyond the MHC: A canine model of dermatomyositis shows a complex pattern of genetic risk involving novel loci》发表于 PLOS Genetics（2017），DOI：10.1371/journal.pgen.1006604。源站首次发布：2017-02-03。
【数据内容】
源站原始描述：Juvenile dermatomyositis (JDM) is a chronic inflammatory myopathy and vasculopathy driven by genetic and environmental influences. Here, we investigated the genetic underpinnings of an analogous, spontaneous disease of dogs also termed dermatomyositis (DMS). As in JDM, we observed a significant association with a haplotype of the major histocompatibility complex (MHC) (DLA-DRB1*002:01/-DQA1*009:01/-DQB1*001:01), particularly in homozygosity (P-val = 0.0001). However, the high incidence of the ha…
【数据结构与技术规格】
文件数 12 个，合计 4.73 MB。pgen.1006604.s001.pdf：application/pdf，2.37 MB。pgen.1006604.s002.pdf：application/pdf，1.35 MB。pgen.1006604.s003.pdf：application/pdf，89.40 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pgen.1006604。
【主题与分类】
源站学科分类：Genetics、Evolutionary Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：risk factors、novel loci Juvenile dermatomyositis、DQA、DQB、DLA-DRB、JDM、DMS、genome-wide association studies、MHC haplotypes、encoding p.Arg 492Cys。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Genetics、Evolutionary Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Beyond_the_MHC_A_canine_model_of_dermatomyositis_shows_a_complex_pattern_of_genetic_risk_involving_novel_loci/4619452
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Evans, Jacquelyn M.; E. Noorai, Rooksana; Tsai, Kate L.; N. Starr-Moss, Alison; Hill, Cody M.; Anderson, Kendall J.; et al. (2017). Beyond the MHC: A canine model of dermatomyositis shows a complex pattern of genetic risk involving novel loci. PLOS Genetics. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-02，引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据说明
该数据集是一个关于犬类皮肌炎（Dermatomyositis, DMS）遗传学研究的基因组数据集。数据集包含通过全基因组关联研究（GWAS）和全基因组重测序获得的遗传变异数据，主要涉及犬类主要组织相容性复合体（MHC）单倍型、染色体10上的PAN2基因（p.Arg492Cys变异）和染色体31上的MAP3K7CL基因（c.383_392ACTCCACAAA>GACT变异）。数据来源于对具有共同祖先的现代犬种的研究，通过分析这些遗传位点的基因型组合与疾病表型的关联，揭示了该复杂疾病的遗传风险模式，包括上位性效应和基因型-表型相关性（如发病年龄与风险等位基因数量的关系）。该数据集主要用于研究复杂自身免疫性疾病的遗传机制，为探索人类幼年型皮肌炎（JDM）及相关免疫功能障碍的遗传基础提供动物模型和潜在靶点。
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