犬类粘液瘤性二尖瓣疾病中瓣膜间质细胞let-7c、miR-17、miR-20a和miR-30d表达失调数据
该数据集包含犬类粘液瘤性二尖瓣疾病(MMVD)研究中,患病与健康对照犬瓣膜间质细胞(VICs)的分子与细胞生物学数据,主要数据模态为基因表达数据(通过RT-qPCR和下一代测序获得的miRNA表达谱)以及细胞表型与功能数据(如蛋白标志物表达、细胞衰老、活力与增殖指标)。其主要用途是探究特定miRNA(let-7c、miR-17、miR-20a、miR-30d)在年龄相关性瓣膜疾病发生发展中的表观遗传调控作用,特别是它们与瓣膜间质细胞向肌成纤维细胞分化、细胞衰老及凋亡过程的关系,为理解人类二尖瓣脱垂等疾病的机制提供重要的实验依据。
基本信息
资源简介
该数据集聚焦于犬类自然发生的粘液瘤性二尖瓣疾病(MMVD),该疾病与人类非综合征性二尖瓣脱垂的早期病理阶段相似。数据集通过对比患病犬与健康对照犬的瓣膜间质细胞(VICs),研究了特定miRNA(包括let-7c、miR-17、miR-20a和miR-30d)的表达变化。数据内容包括:通过RT-qPCR和下一代测序技术获得的miRNA表达谱;VICs的表型特征(如vimentin、α-SMA表达);细胞衰老标志物(p21、SA-β-gal)水平;以及细胞活力和增殖潜力评估。数据来源为从患病和对照瓣膜中分离培养的原代VIC细胞系。该数据集主要应用于研究年龄相关性心脏瓣膜疾病的表观遗传调控机制,特别是miRNA在瓣膜间质细胞肌成纤维细胞分化、细胞衰老和凋亡中的作用,为理解人类二尖瓣疾病的发病机制提供动物模型参考。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://search.dataone.org/view/null
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集聚焦于犬类自然发生的粘液瘤性二尖瓣疾病(MMVD),该疾病与人类非综合征性二尖瓣脱垂的早期病理阶段相似。数据集通过对比患病犬与健康对照犬的瓣膜间质细胞(VICs),研究了特定miRNA(包括let-7c、miR-17、miR-20a和miR-30d)的表达变化。数据内容包括:通过RT-qPCR和下一代测序技术获得的miRNA表达谱;VICs的表型特征(如vimentin、α-SMA表达);细胞衰老标志物(p21、SA-β-gal)水平;以及细胞活力和增殖潜力评估。数据来源为从患病和对照瓣膜中分离培养的原代VIC细胞系。该数据集主要应用于研究年龄相关性心脏瓣膜疾病的表观遗传调控机制,特别是miRNA在瓣膜间质细胞肌成纤维细胞分化、细胞衰老和凋亡中的作用,为理解人类二尖瓣疾病的发病机制提供动物模型参考。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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