致病变异损害心肌病细胞组成与单细胞转录

数据集获取

源站：https://cellxgene.cziscience.com/collections/e75342a8-0f3b-4ec5-8ee1-245a23e0f7cb

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

导致扩张型心肌病（DCM）和致心律失常性心肌病（ACM）的基因致病性变异通过未知机制带来心力衰竭发生的高风险。利用单核RNA测序（snRNAseq），我们对来自18例对照和61例衰竭的非缺血性人类心脏的880,000个细胞核的转录组进行了表征，这些心脏携带DCM和ACM基因的致病性变异或患有特发性疾病。我们对心室细胞谱系和转录状态进行了基因型分层分析。由此产生的DCM和ACM心室细胞图谱展示了不同的右心室和左心室反应，突出了基因型相关通路、细胞间相互作用以及单细胞分辨率下的差异基因表达。这些数据共同阐明了人类心力衰竭共有和独特的细胞与分子结构，并提示了候选治疗靶点。疾病：致心律失常性右心室心肌病、扩张型心肌病、非致密化心肌病、正常。组织：心尖、心脏左心室、心脏右心室、室间隔。检测方法：10x 3‘ v2、10x 3’ v3。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。