尿毒症血清改变基因表达谱与信号通路活性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE343584

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尿毒症状态在终末期肾病(ESKD)患者中很常见。尿毒症患者血管疾病的加速发展会导致心力衰竭、卒中和高血压。为探究尿毒症对猪动脉和静脉平滑肌细胞(aSMCs和vSMCs)的影响，采用bulk RNA测序来识别尿毒症诱导的aSMCs信号通路改变，这些改变可能解释慢性肾脏病(CKD)和ESKD患者中出现的侵袭性心血管疾病。对用正常或尿毒症猪血清培养的猪aSMCs进行了bulk RNA测序。差异表达基因(DEGs)分析显示，暴露于尿毒症血清后，aSMCs中有295个基因上调，138个基因下调。在vSMCs中，DEGs分析显示，尿毒症血清处理后，有408个基因上调，387个基因下调。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。