经典猪瘟病毒感染外周血单个核细胞的全局转录谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE276190

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

古典猪瘟病毒（CSFV）是引起猪高传染性疾病的病原体。为解决其致病机制中的问题奠定基础，本研究采用微阵列分析检测了猪感染中国高毒力CSFV石门株后外周血单个核细胞（PBMC）的基因转录谱。三头易感猪经肌肉注射致死剂量（1.0 × 10^6 TCID50）的CSFV。猪表现出典型的CSF症状、与CSFV感染一致的淋巴细胞和单核细胞减少，且PBMC中亦确认存在CSFV基因组。于接种后第1、3、6和9天（dpi）分离PBMC。提取总RNA并进行微阵列分析。数据显示，感染后共有847个基因表达发生改变，其中467个基因功能已知，其余380个基因功能未知；541个基因上调，306个基因下调。在1、3、6和9 dpi分别出现54、181、438和354个上调基因以及61、120、218和145个下调基因。

这些基因涉及免疫反应（14.5%）、细胞凋亡（3.3%）、信号转导（7.6%）、转录（4.4%）、代谢（11%）、运输（3.9%）、发育（6.8%）和细胞周期（3.7%）。结果表明，该方法在探索CSFV致病机制方面具有实用性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。