GNPS 慢性恰加斯性与特发性晚期心肌病心脏移植患者代谢组学洞察数据集
该数据集来自 omicsdi.org,聚焦循环系统疾病中的心力衰竭,收录了晚期心力衰竭并接受心脏移植评估患者的血浆代谢组学信息

基本信息
资源简介
GNPS 慢性恰加斯性与特发性晚期心肌病心脏移植患者代谢组学洞察数据集
该数据集名为 GNPS - Metabolomic Insights in Advanced Cardiomyopathy of Chronic Chagasic and Idiopathic Patients that Underwent Heart Transplant,来源于 omicsdi.org,在分类上归属于循环系统疾病中的心力衰竭方向,主题标签为代谢组学。数据集聚焦于晚期心力衰竭患者在接受心脏移植评估过程中的血浆代谢组学特征,涵盖慢性恰加斯心肌病与特发性扩张型心肌病两类病因背景的个体,并纳入心脏供体个体作为对照。其核心价值在于以代谢组学视角呈现晚期心力衰竭不同病因之间的血浆代谢轮廓差异,为理解心力衰竭的代谢改变及移植相关评估提供数据基础。
【数据集背景】
心力衰竭是多种心脏疾病的终末阶段,晚期患者常需评估心脏移植指征。不同病因导致的心力衰竭在代谢层面可能存在差异,而慢性恰加斯心肌病与特发性扩张型心肌病是其中两类具有代表性的病因。该数据集正是在这一背景下产生,旨在刻画晚期心力衰竭患者在接受心脏移植评估时的血浆代谢组学特征,并引入心脏供体个体作为参照,以支持对疾病相关代谢变化的观察与分析。
【数据内容】
数据集收录了晚期心力衰竭并接受心脏移植评估患者的血浆代谢组学信息。根据源站描述,研究对象包括15例晚期心力衰竭患者,其中8例为慢性恰加斯心肌病,7例为特发性扩张型心肌病;同时纳入12例心脏供体个体。数据内容围绕血浆代谢组学展开,采用气相色谱/四极杆飞行时间质谱技术进行检测,属于代谢组学主题范畴。数据集分类为循环系统疾病/心力衰竭,主题标签为代谢组学。
【采集与来源】
该数据集来自 omicsdi.org。源站描述指出,研究使用气相色谱/四极杆飞行时间质谱(gas chromatography/quadrupole time-of-flight mass spectrometry)对血浆代谢组学轮廓进行表征。样本来源为晚期心力衰竭并转诊接受心脏移植的患者,以及心脏供体个体。关于具体的样本采集流程、时间节点、机构信息及伦理审批等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于代谢组学与心力衰竭交叉领域的研究场景,可用于探索晚期心力衰竭患者与心脏供体个体之间的血浆代谢差异,也可用于比较慢性恰加斯心肌病与特发性扩张型心肌病两类病因背景下的代谢轮廓特征。此外,该数据集可为心脏移植评估相关的代谢标志物发现、代谢通路分析及病因分型研究提供数据支持。由于涉及特定病因与移植背景,其适用场景主要集中于循环系统疾病中的心力衰竭方向。
【使用方法】
该数据集可通过 omicsdi.org 获取。使用时可结合代谢组学分析流程,对气相色谱/四极杆飞行时间质谱产生的血浆代谢数据进行处理与解读。具体的数据格式、下载方式、预处理步骤、统计分析工具及参数设置等,源站未提供。使用者应根据自身研究目的,在遵守相关数据使用规范的前提下开展分析。
【质量与限制】
该数据集基于特定样本群体,包括15例晚期心力衰竭患者(8例慢性恰加斯心肌病、7例特发性扩张型心肌病)和12例心脏供体个体,样本量相对有限,可能影响统计效力与结论外推。研究采用气相色谱/四极杆飞行时间质谱技术,其检测范围与灵敏度受方法学特性影响。关于数据质量评估、缺失值情况、批次效应、验证实验及重复性等信息,源站未提供。此外,该数据集聚焦于特定病因与移植评估背景,结论不宜直接推广至其他心力衰竭人群。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款及版权信息,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应参考 omicsdi.org 及原始数据发布方的相关规定。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/gnps/MSV000092522
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
采用气相色谱/四极杆飞行时间质谱技术,对15例因晚期心力衰竭转诊心脏移植的患者(8例慢性恰加斯心肌病和7例特发性扩张型心肌病)及12例心脏捐献者的血浆代谢组学特征进行了表征。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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