PXD003926:猪缺血/再灌注损伤模型心脏细胞外基质重塑的蛋白质组学分析——胍提取梗死灶局灶区

本研究旨在对猪缺血/再灌注损伤模型应用基于细胞外基质富集与质谱分析的蛋白质组学方法,以表征心肌梗死后细胞外基质重塑。猪的生理与解剖与人相似,便于比较不同心脏区域,从而建立细胞外基质重塑过程准确的时间与空间模式

pride
2016-04-11 更新
浏览 24
蛋白质HeartPigExtracellular matrix
PXD003926: Proteomics analysis of cardiac extracellular matrix remodeling in a porcine model of ischemia/reperfusion injury Guanidine Infarct, focal area

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2016-04-11

资源简介

PXD003926:猪缺血/再灌注损伤模型心脏细胞外基质重塑的蛋白质组学分析——胍提取梗死灶局灶区

本研究旨在对猪缺血/再灌注损伤模型应用基于细胞外基质富集与质谱分析的蛋白质组学方法,以表征心肌梗死后细胞外基质重塑。猪的生理与解剖与人相似,便于比较不同心脏区域,从而建立细胞外基质重塑过程准确的时间与空间模式。相关标签涉及心脏、猪、细胞外基质、心肌缺血、Sus scrofa及LTQ Orbitrap(来源 ebi.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在通过将一种基于ECM富集和MS分析的蛋白质组学方法应用于猪缺血/再灌注损伤模型,来表征心肌梗死后的ECM重塑。猪与人类相似的生理学和解剖学特征有助于比较不同心脏区域,从而建立ECM重塑过程的准确时间与空间模式。

【主题与分类】

主题标签:Heart、Pig、Extracellular matrix。本站分类:循环系统疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003926

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

本研究旨在通过将一种基于ECM富集和MS分析的蛋白质组学方法应用于猪缺血/再灌注损伤模型,来表征心肌梗死后的ECM重塑。猪与人类相似的生理学和解剖学特征有助于比较不同心脏区域,从而建立ECM重塑过程的准确时间与空间模式。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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