线粒体MICOS复合物基因与左心发育不全综合征相关,维持心脏收缩力和肌动球蛋白完整性

该数据集包含左心发育不全综合征(HLHS)患者及其家庭的全基因组测序数据、候选基因功能验证结果以及线粒体MICOS复合物相关基因的果蝇模型实验数据,主要模态为基因序列和实验测量数据,用于研究HLHS的遗传病因和心脏收缩功能维持的分子机制,特别是线粒体功能在先天性心脏病中的作用。

DataONE
2023-07-04 更新
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基因组学心脏疾病

基本信息

创建/更新时间
2023-07-04

资源简介

该数据集聚焦于左心发育不全综合征(HLHS),一种严重的先天性心脏病,其病因可能涉及寡基因遗传。研究通过全基因组测序(WGS)对大量HLHS患者及其家庭进行基因分析,以识别候选基因,并在果蝇心脏模型中验证其功能与结构作用。数据集包含来自近亲结婚家庭中HLHS先证者的WGS数据,通过生物信息学分析筛选出9个携带罕见、预测有害纯合变异的候选基因。其中,对线粒体MICOS复合物亚基dCHCHD3/6进行心脏特异性敲低后,发现其导致心脏收缩功能严重受损、肌节肌动蛋白和肌球蛋白水平降低、心脏ATP水平下降以及线粒体分裂-融合异常。该数据集支持心脏发育与功能相关的遗传机制研究,为HLHS的病理生理学提供分子层面的见解,并可用于探索线粒体功能在心脏疾病中的作用。

原始链接

https://search.dataone.org/view/sha256:2491455c089bbea75188d2e874e3d2b1a778aab852f4992e41cafe1a40da83ff

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数据说明

该数据集聚焦于左心发育不全综合征(HLHS),一种严重的先天性心脏病,其病因可能涉及寡基因遗传。研究通过全基因组测序(WGS)对大量HLHS患者及其家庭进行基因分析,以识别候选基因,并在果蝇心脏模型中验证其功能与结构作用。数据集包含来自近亲结婚家庭中HLHS先证者的WGS数据,通过生物信息学分析筛选出9个携带罕见、预测有害纯合变异的候选基因。其中,对线粒体MICOS复合物亚基dCHCHD3/6进行心脏特异性敲低后,发现其导致心脏收缩功能严重受损、肌节肌动蛋白和肌球蛋白水平降低、心脏ATP水平下降以及线粒体分裂-融合异常。该数据集支持心脏发育与功能相关的遗传机制研究,为HLHS的病理生理学提供分子层面的见解,并可用于探索线粒体功能在心脏疾病中的作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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