Piezo1 整合血管结构与生理力 LC-MSMS 数据集
数据围绕离子通道亚基 Piezo1(FAM38A)在血管发育与血流力学感知中的作用,涉及剪切应力诱导的内皮细胞离子电流、钙内流及下游蛋白酶活性和细胞极性组织

基本信息
资源简介
Piezo1 整合血管结构与生理力 LC-MSMS 数据集
该数据集来自 ebi.ac.uk,英文名为 PXD001099: Piezo1 integration of vascular architecture with physiological force LC-MSMS,属于循环系统疾病/其他分类。数据围绕离子通道亚基 Piezo1(FAM38A)在血管发育与血流力学感知中的作用,涉及剪切应力诱导的内皮细胞离子电流、钙内流及下游蛋白酶活性和细胞极性组织。采用非标记定量与磷酸化蛋白质组学方法,涵盖人类与小鼠样本,可用于研究 Piezo1 介导的力学信号转导及血管架构整合机制(来源 ebi.ac.uk)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):物理力调控细胞以决定血管结构和功能复杂性的机制尚不清楚。在此我们展示了离子通道亚基 Piezo1(FAM38A)的作用。破坏小鼠 Piezo1 基因会扰乱血管发育,并在心脏开始跳动产生血流后数天内导致胚胎致死。Piezo 通道作为血流传感器的重要性由以下事实表明:内皮细胞中剪切应力诱发的离子电流和钙内流依赖于 Piezo1,并且外源性 Piezo1 能够赋予原本缺乏剪切应力敏感性的细胞以该敏感性。这种钙内流的下游是蛋白酶活性和内皮细胞对施加力极性的空间组织。没有 Piezo1,正常的内皮细胞组织就缺失。这些数据表明 Piezo1 通道是血管结构与生理力的关键整合者。
【主题与分类】
主题标签:Shear stress、Human、Mouse、Piezo1、Label-free、Phosphoproteomics。本站分类:循环系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD001099
下载信息
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数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD001099
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- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
物理力调控细胞以决定血管结构和功能复杂性的机制尚不清楚。在此,我们展示了离子通道亚基Piezo1(FAM38A)的作用。小鼠Piezo1基因的破坏扰乱了血管发育,并在心脏开始跳动以产生血流的数天内导致胚胎致死。Piezo通道作为血流感受器的重要性体现在:内皮细胞中剪切应力诱发的离子电流和钙内流依赖于Piezo1,以及外源性Piezo1能够赋予原本缺乏剪切应力敏感性的细胞以该敏感性。此钙内流的下游是蛋白酶活性和内皮细胞的空间组织与所施加力极性的关系。缺乏Piezo1时,正常的内皮细胞组织缺失。这些数据表明,Piezo1通道是血管结构与生理机械力之间的关键整合者。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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