PRJEB65847：AL淀粉样变性与多发性骨髓瘤患者kappa轻链序列多样性数据集
背景：AL淀粉样变性（AL）由免疫球蛋白轻链（IG LCs）错误折叠引起。本研究旨在全面分析AL患者的kappa轻链序列，并与多发性骨髓瘤（MM）进行比较
基本信息
资源简介
PRJEB65847：AL淀粉样变性与多发性骨髓瘤患者kappa轻链序列多样性数据集
PRJEB65847 数据集聚焦于 AL 淀粉样变性与多发性骨髓瘤患者 kappa 轻链的序列多样性，来源于 EBI（ebi.ac.uk），在本站归类于循环系统疾病 / 其他。该数据集围绕免疫球蛋白轻链（IG LCs）错误折叠这一 AL 淀粉样变性的发生机制，对 AL 患者与多发性骨髓瘤（MM）患者的 kappa 轻链序列进行比较性分析，涵盖 IGKV/IGKJ 使用情况、相关器官嗜性以及 IGKV1/D-33 的突变分析与理论生化性质等内容，为理解两类疾病中轻链序列特征的异同提供了数据基础。
【数据集背景】
AL 淀粉样变性由免疫球蛋白轻链（IG LCs）的错误折叠引起。该数据集对应的研究旨在全面分析 AL 患者的 kappa 轻链序列，并与多发性骨髓瘤（MM）进行对比。研究的具体目标包括分析 IGKV/IGKJ 的使用情况及其与器官嗜性的关联，并针对 IGKV1/D-33 开展突变分析和理论生化性质分析。
【数据内容】
数据集内容为 AL 与 MM 患者轻链的 cDNA 及 bulk RNA 测序数据，用于 kappa 轻链序列的分析。研究共纳入 41 例 AL 患者和 83 例 MM 患者。分析结果显示，IGKV1 在 kappa 型 AL 与 MM 中表达最高，且在 AL 中的频率更高（80% 对 53%，p=0.002）；IGKV3 在 AL 中占比偏低（10% 对 30%，p=0.014）；IGKJ2 在 AL 中的使用比 MM 更常见（39% 对 29%）。携带 IGKV1/D-33 的患者与心脏受累相关（75%，p=0.024）。AL 的 IGKV1/D-33 片段突变数更高（AL=12.0，MM 侧数值在源站描述中未完整给出）。
【采集与来源】
数据集来源于 ebi.ac.uk。样本来自 AL 淀粉样变性与多发性骨髓瘤患者，检测材料为患者轻链的 cDNA，并采用 bulk RNA 测序获取序列信息。源站描述未提供更详细的采样地点、时间范围与伦理审批信息。
【适用场景】
该数据集适用于免疫球蛋白轻链序列层面的比较研究，例如 AL 与 MM 之间 IGKV/IGKJ 使用偏好的差异分析、IGKV1/D-33 与心脏受累关联的验证性研究，以及 kappa 轻链突变负荷与理论生化性质的探索。也可用于循环系统疾病相关研究中涉及轻链序列特征的参考分析。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明。使用者可依据数据集所含的 cDNA 与 bulk RNA 测序数据开展 kappa 轻链序列分析，具体分析流程与参数设置需参考源站相关记录。
【质量与限制】
源站描述给出了样本量（41 例 AL、83 例 MM）及多项统计检验结果，但未提供数据质量评估、测序深度、覆盖度等质控指标。MM 组 IGKV1/D-33 的突变数数值在源站描述中不完整，相关比较的完整结论无法据此确定。数据集仅涉及 kappa 轻链，未涵盖 lambda 轻链信息。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB65847
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景：AL淀粉样变性（AL）由免疫球蛋白轻链（IG LCs）错误折叠所致。本研究旨在全面分析AL患者的kappa轻链序列，并与多发性骨髓瘤（MM）进行比较。目的：我们分析了IGKV/IGKJ的使用情况及其相关的器官趋向性，并对IGKV1/D-33进行了突变分析和理论生化特性分析。材料与方法：对AL和MM患者轻链的cDNA及bulk RNA进行测序。结果：我们研究了41例AL和83例MM患者，结果显示IGKV1在kappa型AL和MM中表达最高，且在AL中频率更高（80% vs. 53%，p=0.002）。IGKV3在AL中表达不足（10% vs. 30%，p=0.014）。IGKJ2在AL中的使用较MM更为常见（39% vs. 29%）。携带IGKV1/D-33的患者与心脏受累相关（75%，p=0.024）。AL中IGKV1/D-33片段的突变数更高（AL=12.0 vs. MM=10.0）。FR3和CDR3在两者中均为最常突变的区域，其中FR3的中位突变数最高（AL=4.0，MM=3.5），且IGKV1/D-33/IGKJ2的一个突变热点（FR3（83I））与心脏受累相关。
结论：本研究证实了种系使用对AL淀粉样变性风险及器官受累具有影响。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
