腹水综合征鸡心脏和肺组织RNA测序分析数据集
腹水综合征（AS）是肉鸡常见的一种营养和代谢紊乱。患病鸡的AS发病率为5%至20%，给家禽业带来了巨大的经济损失。在本研究中，我们进行了RNA测序分析，以筛选与肉鸡腹水综合征发展相关的关键通路和基因，并为其发病机制和潜在预防策略提供了有价值的见解
基本信息
资源简介
腹水综合征鸡心脏和肺组织RNA测序分析数据集
腹水综合征（Ascites Syndrome，AS）是肉鸡常见的一种营养和代谢紊乱，患病鸡的发病率可达5%至20%，给家禽业造成了巨大的经济损失。为探究该病的发生机制，相关研究对患病鸡的心脏和肺组织开展了RNA测序分析，旨在筛选与肉鸡腹水综合征发展相关的关键通路和基因，为理解其发病机制及潜在预防策略提供有价值的线索。该数据集即为该项研究的转录组测序数据集合，收录于本站循环系统疾病/其他分类之下，来源站为ebi.ac.uk，数据集英文名称为PRJDB38961: RNA sequencing analysis of heart and lung tissues from chickens with ascites syndrome (PRJCA043057)。
【数据集背景】
腹水综合征是肉鸡养殖中一种常见的营养和代谢紊乱性疾病。该病在患病鸡群中的发病率介于5%至20%之间，发病范围较广，由此给家禽产业带来了巨大的经济损失。由于该病涉及营养与代谢层面的紊乱，其发病机制较为复杂，亟需从分子层面寻找与疾病发展相关的关键通路和基因。在此背景下，研究者针对肉鸡腹水综合征开展了RNA测序分析，希望通过转录组水平的筛查，揭示与疾病发展相关的分子特征，并为发病机制阐释和预防策略制定提供依据。该数据集正是这一研究工作的数据载体。
【数据内容】
该数据集的核心内容为鸡心脏和肺组织的RNA测序分析数据。研究以患腹水综合征的肉鸡为对象，选取心脏与肺这两种与循环及呼吸功能密切相关的组织进行转录组测序，用于筛选与腹水综合征发展相关的关键通路和基因。数据集名称中同时包含了PRJDB38961与PRJCA043057两个编号标识，表明其对应的研究登记信息。除上述组织类型与研究目的外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、数据量、基因注释版本等更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于ebi.ac.uk，属于公开可获取的研究数据资源。其研究对象为患有腹水综合征的肉鸡，采集的组织材料为心脏和肺组织，采集后用于RNA测序分析。研究目的在于通过测序筛选与疾病发展相关的关键通路和基因。关于具体的采样地点、采样时间、样本分组方式、饲养条件以及测序服务的提供方等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于该数据集的研究定位，其适用场景主要包括：围绕肉鸡腹水综合征发病机制开展的转录组水平研究，例如差异表达分析、通路富集分析以及关键基因筛选；针对心脏和肺组织在腹水综合征发展过程中分子变化特征的比较研究；以及为腹水综合征的预防策略探索提供数据支撑的探索性分析。此外，该数据集也可作为家禽营养与代谢紊乱相关研究的参考数据。需要说明的是，上述适用场景系依据该数据集的研究目的与组织类型所作的合理归纳，源站未提供关于数据具体适用范围或验证结论的进一步说明。
【使用方法】
该数据集为RNA测序分析数据，使用者可按照转录组数据的常规分析流程，对心脏和肺组织的测序结果进行基因表达定量、差异表达分析以及通路层面的功能分析，以筛选与腹水综合征发展相关的关键通路和基因。关于数据的具体文件格式、下载方式、预处理步骤、参考基因组版本及分析参数等操作层面的信息，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集聚焦于肉鸡腹水综合征的心脏和肺组织RNA测序分析，具有明确的疾病与组织针对性。其局限性在于：源站未提供样本规模、测序深度、数据质控指标、重复设置以及结果验证情况等信息，因此难以对数据质量作出具体评估；同时，该数据仅涉及心脏和肺两种组织，源站未说明是否涵盖其他组织或与其他品系、其他饲养条件下的样本进行比较。使用者在解读结果时需结合自身研究设计加以判断。
【引用与许可】
该数据集来源于ebi.ac.uk，其英文名称中包含PRJDB38961与PRJCA043057等登记编号，可作为数据定位与引用的依据。关于该数据集的具体许可协议、使用条款以及正式引用文献等信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB38961
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
腹水综合征（AS）是肉鸡常见的营养代谢性疾病，发病鸡群的发病率约为5%至20%，给家禽业造成了巨大的经济损失。本研究通过RNA测序分析，筛选与肉鸡腹水综合征发生发展相关的关键通路和基因，为其发病机制及潜在预防策略提供了有价值的见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
