PRJDB38887：腹水综合征鸡心与肺组织基因组DNA甲基化测序分析（PRJCA042977）
腹水综合征（AS）是肉鸡常见的一种营养代谢障碍。患病鸡的 AS 发病率为 5% 至 20%，给家禽业带来了巨大的经济损失
基本信息
资源简介
PRJDB38887：腹水综合征鸡心与肺组织基因组DNA甲基化测序分析（PRJCA042977）
PRJDB38887 数据集围绕肉鸡腹水综合征（Ascites syndrome，AS）展开，是一项针对心脏与肺组织的基因组 DNA 甲基化测序分析。腹水综合征是肉鸡常见的一种营养代谢障碍，患病鸡群的发病率可达 5% 至 20%，给家禽业造成巨大的经济损失。该数据集通过全基因组 DNA 甲基化测序，旨在筛选与肉鸡腹水综合征发生发展相关的关键通路和基因，为理解其发病机制以及探索潜在的预防策略提供线索。数据集归属于循环系统疾病 / 其他分类，来源站为 ebi.ac.uk，适合关注家禽代谢性疾病、表观遗传调控与动物健康的研究者参考使用。
【数据集背景】
腹水综合征是肉鸡常见的一种营养代谢障碍，在受影响鸡群中的发病率介于 5% 至 20% 之间，给家禽业带来了巨大的经济损失。该综合征的发生涉及营养与代谢层面的异常，其分子层面的调控机制仍有待深入解析。本数据集正是在这一背景下产生，研究者以心脏和肺组织为对象，采用全基因组 DNA 甲基化测序分析，试图从表观遗传角度寻找与腹水综合征发展相关的关键通路与基因，从而为该病的发病机制研究和潜在预防策略提供有价值的见解。
【数据内容】
该数据集的核心内容是针对肉鸡心脏与肺组织开展的基因组 DNA 甲基化测序分析结果。研究聚焦于腹水综合征发生过程中 DNA 甲基化层面的变化，目标是筛选出与该病发展相关的关键通路和基因。数据集英文名称为“PRJDB38887: The genome DNA methylation sequencing analysis of heart and lung tissues from chickens with ascites syndrome (PRJCA042977)”。除上述测序分析的主题与组织来源外，源站未提供关于样本数量、测序平台、数据文件类型与具体大小的进一步说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。研究对象为患有腹水综合征的肉鸡，采集的组织类型为心脏与肺组织，所采用的技术路线为全基因组 DNA 甲基化测序分析。关于采样地点、采样时间、样本分组方式、测序深度与原始数据产出等具体采集信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其研究主题，该数据集可应用于以下方向：一是研究肉鸡腹水综合征发生发展过程中与心脏、肺组织相关的 DNA 甲基化变化；二是筛选与该病相关的关键通路和基因，为发病机制研究提供线索；三是为家禽营养代谢障碍的表观遗传研究提供参考；四是为探索该病的潜在预防策略提供数据支撑。需要说明的是，上述场景均围绕源站描述所提及的研究目标展开，源站未提供针对其他物种、其他组织或其他疾病的具体适用性说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件格式说明、分析流程与参数设置等。使用者如需使用，应参照来源站 ebi.ac.uk 上该数据集对应页面的说明进行操作。
【质量与限制】
源站未提供关于该数据集质量评估、数据完整性、批次效应或技术偏差等方面的具体信息。已知的限制在于：该数据集仅涉及肉鸡心脏与肺组织的 DNA 甲基化测序分析，源站描述未提及其他组织类型或其他组学层面；其研究结论的适用范围应以源站描述中关于腹水综合征发病机制与预防策略的表述为限。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在引用或再利用该数据集前，应查阅来源站 ebi.ac.uk 上对应数据集页面的最新说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB38887
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
腹水综合征（AS）是肉鸡常见的营养代谢性疾病，发病鸡群的发病率为5%～20%，给家禽业带来了巨大的经济损失。本研究通过全基因组DNA甲基化测序分析，筛选与肉鸡腹水综合征发生发展相关的关键通路和基因，为其发病机制及潜在预防策略提供了有价值的见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
