成年太平洋鲑鱼和鳟鱼（大麻哈鱼属）多种RNA病毒分子检测数据集

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/e7b67428-8895-4ceb-b7c1-3b1e8202021d

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

用于出版物《对成年太平洋鲑鱼和鳟鱼（Oncorhynchus spp.）进行多种RNA病毒分子检测显示，鱼正呼肠孤病毒（PRV）在阿拉斯加和华盛顿广泛分布》的数据集。本研究是与美国多个机构联合开展的系统性监测工作相结合而启动的，该监测旨在回应加拿大不列颠哥伦比亚省报告的传染性鲑鱼贫血病毒（ISAV）RNA检测结果。在姊妹论文中报告的系统性监测研究中，采用美国批准的诊断方法对来自华盛顿和阿拉斯加的各种鲑科鱼类组织进行了ISAV RNA检测，样本仅在检测为阴性后才被放行用于本研究。在此，我们用三种其他已发表的分子检测方法对其中一部分样本进行了ISAV RNA检测，同时检测了鲑科甲病毒（SAV）、鱼心肌炎病毒（PMCV）和鱼正呼肠孤病毒（PRV）的RNA。所有样本（n=2252；121个种群队列）对ISAV、PMCV和SAV的RNA检测均为阴性。相比之下，来自华盛顿和阿拉斯加的25个种群队列中有一个或多个个体对PRV RNA检测呈阳性。

PRV RNA的检出在银鲑（Oncorhynchus kisutch Walbaum）和奇努克鲑（O. tshawytscha Walbaum）中最为常见。与大西洋鲑中PRV相关的疾病——心脏骨骼肌炎症（HSMI），在太平洋鲑鱼中尚未有报道。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。