Ang II 输注小鼠腹主动脉瘤数据集:肾上分支破裂与管腔扩张

主题标签:腹主动脉瘤、Ang II 输注小鼠、组织学、同步辐射成像、超声、血管破裂。本数据集为循环系统疾病领域公开数据集,由Zenodo提供,主题涵盖腹主动脉瘤。

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医学影像图像分割腹主动脉瘤Ang II 输注小鼠组织学同步辐射成像超声血管破裂
Dataset for "Dissecting abdominal aortic aneurysm in Ang II-infused mice: suprarenal branch ruptures and apparent luminal dilatation"

基本信息

模态
医学影像
大小
8.204639343 GB
任务类型
图像分割
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

Ang II 输注小鼠腹主动脉瘤数据集:肾上分支破裂与管腔扩张

本数据集围绕血管紧张素II(Ang II)输注小鼠模型中的腹主动脉瘤展开,包含组织学、同步辐射成像与超声三类数据,对应2014年发表于《Cardiovascular Research》的研究论文《Dissecting abdominal aortic aneurysm in Ang II-infused mice: suprarenal branch ruptures and apparent luminal dilatation》。数据集由Zenodo发布,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可,面向循环系统疾病领域的研究者开放。其核心价值在于为腹主动脉瘤的病理机制研究,尤其是肾上分支破裂与管腔扩张的表观现象,提供多模态影像与组织学证据。数据文件名与研究中使用的每只小鼠编号一一对应,便于追溯个体层面的观察结果。

【数据集背景】

腹主动脉瘤是一种以血管壁进行性扩张和破裂风险为特征的循环系统疾病。该数据集所依托的研究聚焦于Ang II输注小鼠模型,旨在剖析该模型中腹主动脉瘤的形成过程,特别关注肾上分支破裂以及管腔的表观扩张现象。相关成果发表于2014年的《Cardiovascular Research》。数据集于2019年由Zenodo发布,归类于循环系统疾病/其他方向,为后续研究者提供了该研究涉及的原始影像与组织学资料。

【数据内容】

数据集包含三类数据:组织学数据、同步辐射成像数据以及超声数据。组织学数据以压缩包形式提供,需使用Olympus公司的OlyVIA软件打开,或借助BIOP工具VSI-reader(作为开源软件Fiji的插件)进行读取。成像数据保存为.mcs格式,可通过商业软件Mimics(Materialise,Leuven,Belgium)打开。所有文件名均与研究中使用的小鼠ID相对应,确保数据与实验个体之间的对应关系清晰可查。

【采集与来源】

数据来源于Ang II输注小鼠模型的实验研究,涉及组织学、同步辐射和超声三种采集手段。研究论文发表于《Cardiovascular Research》2014年刊。数据集由Zenodo提供,作者包括Trachet, Bram、Fraga-Silva, Rodrigo、Piersigilli, Allessandra、Tedgui, Alain、Sordet-Dessimoz, Jessica、Astolfo, Alberto、Van der Donckt, Carole、Modregger, Peter、Stampanoni, Marco、Segers, Patrick、Stergiopul等。发布时间为2019年。

【适用场景】

该数据集适用于腹主动脉瘤相关的基础与转化研究,尤其是针对Ang II输注小鼠模型中肾上分支破裂和管腔扩张机制的探讨。组织学数据可用于血管壁结构的病理学观察;同步辐射成像与超声数据可用于血管形态和管腔变化的分析。由于文件名与小鼠ID对应,研究者可按个体整合多模态数据,开展跨模态比较。此外,该数据集也可用于影像处理方法、分割算法或三维重建技术的验证与开发。

【使用方法】

使用组织学数据时,需先解压压缩包,然后使用OlyVIA软件或Fiji的VSI-reader插件打开。成像数据为.mcs格式,需使用Mimics软件读取。由于文件名对应研究中的小鼠ID,使用者应依据该编号体系关联不同模态的数据。源站未提供其他具体操作步骤或分析流程。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、样本量、缺失情况或技术偏差的具体说明。使用者需注意,组织学数据依赖特定软件(OlyVIA或Fiji插件)打开,成像数据依赖商业软件Mimics,可能对软件获取和版本兼容性提出要求。此外,数据集仅包含该研究相关的组织学、同步辐射和超声数据,未涵盖其他模态或临床信息。源站未提供数据质量控制或验证结果的详细描述。

【引用与许可】

该数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可,允许在署名前提下共享与改编。引用时需注明数据集来源及对应论文。作者列表包括Trachet, Bram、Fraga-Silva, Rodrigo、Piersigilli, Allessandra、Tedgui, Alain、Sordet-Dessimoz, Jessica、Astolfo, Alberto、Van der Donckt, Carole、Modregger, Peter、Stampanoni, Marco、Segers, Patrick、Stergiopul等。发布机构为Zenodo,发布时间为2019年。源站未提供具体的引用格式或DOI之外的标识信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.2649131

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 8.20 GB。

数据说明

该数据集包含手稿《血管紧张素II输注小鼠腹主动脉瘤剖析:肾上分支破裂与明显管腔扩张》的组织学、同步辐射和超声数据,该手稿于2014年发表在《心血管研究》上。组织学数据已压缩,需使用Olympus软件OlyVIA打开,或使用BIOP工具VSI-reader打开,后者是开源软件Fiji的一个插件。影像数据以.mcs格式保存,可使用商业软件Mimics(Materialise,鲁汶,比利时)打开。文件名与研究中使用的小鼠ID相对应。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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