严重风湿性心脏病数据独立采集质谱鉴定持续炎症蛋白质组特征并有效分类RHD病例
jing yang,严重风湿性心脏病(RHD)中的数据独立采集质谱鉴定出显示持续炎症的蛋白质组特征并有效分类 RHD 病例

基本信息
资源简介
严重风湿性心脏病数据独立采集质谱鉴定持续炎症蛋白质组特征并有效分类RHD病例
该数据集围绕严重风湿性心脏病(Rheumatic Heart Disease, RHD)的蛋白质组学研究展开,采用数据独立采集(Data Independent Acquisition, DIA)质谱技术对严重 RHD 病例进行分析,旨在鉴定与疾病相关的蛋白质组特征。研究结果显示,严重 RHD 患者中存在持续炎症相关的蛋白质组信号,并且所获得的蛋白质组特征能够有效区分 RHD 病例。数据集由 jing yang 提交,收录于 EBI 的 PRIDE 蛋白质组学数据平台,项目编号为 PXD030598。本站将其归类于循环系统疾病下的其他类别。该数据集适用于蛋白质组学、风湿性心脏病生物标志物及炎症机制等方向的研究参考,具体样本构成、实验流程与统计结果等细节需以源站记录为准。
【数据集背景】
风湿性心脏病是风湿热反复发作后遗留的心脏瓣膜损害性疾病,严重病例可导致瓣膜功能障碍与心力衰竭,属于循环系统疾病范畴。寻找能够反映疾病活动状态的分子标志物,对理解 RHD 的持续炎症过程与病例识别具有研究价值。该数据集正是针对严重 RHD 场景,利用数据独立采集质谱技术开展蛋白质组层面的探索,试图从蛋白质表达特征中捕捉与持续炎症相关的信号,并评估这些特征对 RHD 病例的分类效能。数据集标题明确指向两个核心目标:鉴定显示持续炎症的蛋白质组特征,以及有效分类 RHD 病例。
【数据内容】
依据源站描述,该数据集为一项蛋白质组学研究的配套数据,主题为严重 RHD 中的数据独立采集质谱分析,其分析结果指向持续炎症相关的蛋白质组特征,并涉及对 RHD 病例的有效分类。数据集以项目形式登记于 PRIDE 归档平台,项目编号为 PXD030598。关于具体的样本数量、蛋白质鉴定数目、差异表达蛋白列表、分类模型所用特征及性能指标等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,具体登记于 PRIDE 蛋白质组学归档项目 PXD030598,提交者为 jing yang。研究采用的技术路线为数据独立采集质谱(DIA),研究对象为严重风湿性心脏病病例。除上述来源与技术类型信息外,采样地点、样本收集时间、仪器型号、色谱与质谱参数等实验细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可服务于风湿性心脏病相关的蛋白质组学研究,例如探索严重 RHD 中持续炎症的分子表现、筛选潜在的蛋白质标志物,以及构建或验证基于蛋白质组特征的病例分类方法。对于循环系统疾病领域的研究者,该数据可作为 DIA 质谱在心血管疾病应用中的参考案例。由于源站未提供样本与结果层面的详细说明,将其用于特定分析前需核对原始记录。其他潜在应用场景源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 PRIDE 归档平台以项目编号 PXD030598 提供访问,使用者可依据该编号在源站检索并获取项目页面所列内容。关于文件格式、下载方式、数据解析流程及配套分析工具等具体使用说明,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集经 PRIDE 平台归档,具备项目编号与明确的提交者信息,来源可追溯。其研究主题与结论方向在源站描述中有明确表述,即鉴定出显示持续炎症的蛋白质组特征并有效分类 RHD 病例。然而,样本规模、数据完整性、定量准确性、统计效力及分类性能的具体数值等质量相关细节,源站未提供,使用时应结合原始项目记录进行评估。该数据集在临床诊断或治疗决策中的直接适用性,源站未提供。
【引用与许可】
引用该数据集时,可参照源站给出的描述格式,注明作者 jing yang、数据集标题、数据集类型以及 PRIDE 项目链接 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD030598。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD030598
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
jing yang, Data independent acquisition mass spectrometry in severe Rheumatic Heart Disease (RHD) identifies a proteomic signature showing ongoing inflammation and effectively classifying RHD cases. [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD030598
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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