免疫球蛋白轻链型淀粉样变性患者心脏淀粉样纤维的Cryo-EM结构

欧洲蛋白质数据库(PDBe)(2019)。免疫球蛋白轻链型(AL)淀粉样变性患者心脏淀粉样纤维的Cryo-EM结构。主题标签:AL型淀粉样变性、心脏淀粉样纤维、Cryo-EM结构、免疫球蛋白轻链、循环系统疾病、PDBe

google_dataset
浏览 2
蛋白质AL型淀粉样变性心脏淀粉样纤维Cryo-EM结构免疫球蛋白轻链循环系统疾病PDBe
Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibrils from an immunoglobulin light chain (AL) amyloidosis patient.

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

免疫球蛋白轻链型淀粉样变性患者心脏淀粉样纤维的Cryo-EM结构

该数据集为一项结构生物学数据资源,收录了来源于免疫球蛋白轻链型(AL)淀粉样变性患者心脏淀粉样纤维的冷冻电镜(Cryo-EM)结构。数据集英文名称为“Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibrils from an immunoglobulin light chain (AL) amyloidosis patient.”,在数据分类中归入循环系统疾病下的“其他”类别,来源站点为欧洲生物信息研究所(ebi.ac.uk),具体由欧洲蛋白质数据库(PDBe)于2019年发布,并配有对应DOI标识。该数据集以AL型淀粉样变性、心脏淀粉样纤维、Cryo-EM结构、免疫球蛋白轻链、循环系统疾病及PDBe为主题标签,面向心脏淀粉样变性相关结构研究提供原始结构数据支撑。

【数据集背景】

AL型淀粉样变性是一种与免疫球蛋白轻链异常沉积相关的疾病,其病理特征之一是淀粉样纤维在组织中的沉积,心脏受累是该类疾病的重要临床表现形式。该数据集正是围绕一名免疫球蛋白轻链型(AL)淀粉样变性患者的心脏淀粉样纤维展开,借助冷冻电镜技术解析其结构。数据由欧洲蛋白质数据库(PDBe)于2019年发布,属于结构生物学与循环系统疾病交叉领域的数据资源,在站点分类中归入“循环系统疾病 / 其他”。

【数据内容】

该数据集的核心内容为心脏淀粉样纤维的Cryo-EM结构。数据集名称明确指向“免疫球蛋白轻链(AL)淀粉样变性患者”的“心脏淀粉样纤维”的“Cryo-EM结构”,主题标签亦涵盖AL型淀粉样变性、心脏淀粉样纤维、Cryo-EM结构、免疫球蛋白轻链等关键词。除上述结构主题信息外,源站未提供关于结构分辨率、纤维组成、原子坐标文件数量等更细化的数据内容说明。

【采集与来源】

该数据集来源于ebi.ac.uk,由欧洲蛋白质数据库(PDBe)发布,发布年份为2019年,对应DOI为10.2210/pdb/6hud/pdb,其结构条目编号可对应为6hud。数据对象的生物学来源为一名免疫球蛋白轻链型(AL)淀粉样变性患者的心脏淀粉样纤维。关于样本采集、制备与冷冻电镜成像的具体实验条件,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与分类,该数据集可服务于AL型淀粉样变性及心脏淀粉样纤维的结构研究,供关注免疫球蛋白轻链相关淀粉样沉积机制的研究者参考;同时因其归入循环系统疾病类别,也可作为循环系统疾病相关结构数据的组成部分用于检索与整合。关于该数据集在药物设计、临床诊断或其他具体应用中的用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过DOI(10.2210/pdb/6hud/pdb)进行标识与访问,使用者可依据该DOI定位至欧洲蛋白质数据库(PDBe)中的对应条目。关于数据文件的下载格式、解析工具、可视化软件及具体使用步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集由欧洲蛋白质数据库(PDBe)于2019年发布,具备明确的来源机构与DOI标识。其研究对象为单一患者的免疫球蛋白轻链型(AL)淀粉样变性心脏淀粉样纤维,样本范围有限。关于数据质量评估指标、结构验证结果、分辨率水平及使用中的其他限制,源站未提供。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参照源站描述形式:Protein Data Bank in Europe (PDBe) (2019). Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibrils from an immunoglobulin light chain (AL) amyloidosis patient. [Dataset]. http://doi.org/10.2210/pdb/6hud/pdb。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pdbe/entry/pdb/6hud/biology

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Protein Data Bank in Europe (PDBe) (2019). Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibrils from an immunoglobulin light chain (AL) amyloidosis patient. [Dataset]. http://doi.org/10.2210/pdb/6hud/pdb

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。