免疫球蛋白轻链型淀粉样变性患者心脏淀粉样纤维的Cryo-EM结构
欧洲蛋白质数据库(PDBe)(2019)。免疫球蛋白轻链型(AL)淀粉样变性患者心脏淀粉样纤维的Cryo-EM结构。主题标签:AL型淀粉样变性、心脏淀粉样纤维、Cryo-EM结构、免疫球蛋白轻链、循环系统疾病、PDBe

基本信息
资源简介
免疫球蛋白轻链型淀粉样变性患者心脏淀粉样纤维的Cryo-EM结构
该数据集为一项结构生物学数据资源,收录了来源于免疫球蛋白轻链型(AL)淀粉样变性患者心脏淀粉样纤维的冷冻电镜(Cryo-EM)结构。数据集英文名称为“Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibrils from an immunoglobulin light chain (AL) amyloidosis patient.”,在数据分类中归入循环系统疾病下的“其他”类别,来源站点为欧洲生物信息研究所(ebi.ac.uk),具体由欧洲蛋白质数据库(PDBe)于2019年发布,并配有对应DOI标识。该数据集以AL型淀粉样变性、心脏淀粉样纤维、Cryo-EM结构、免疫球蛋白轻链、循环系统疾病及PDBe为主题标签,面向心脏淀粉样变性相关结构研究提供原始结构数据支撑。
【数据集背景】
AL型淀粉样变性是一种与免疫球蛋白轻链异常沉积相关的疾病,其病理特征之一是淀粉样纤维在组织中的沉积,心脏受累是该类疾病的重要临床表现形式。该数据集正是围绕一名免疫球蛋白轻链型(AL)淀粉样变性患者的心脏淀粉样纤维展开,借助冷冻电镜技术解析其结构。数据由欧洲蛋白质数据库(PDBe)于2019年发布,属于结构生物学与循环系统疾病交叉领域的数据资源,在站点分类中归入“循环系统疾病 / 其他”。
【数据内容】
该数据集的核心内容为心脏淀粉样纤维的Cryo-EM结构。数据集名称明确指向“免疫球蛋白轻链(AL)淀粉样变性患者”的“心脏淀粉样纤维”的“Cryo-EM结构”,主题标签亦涵盖AL型淀粉样变性、心脏淀粉样纤维、Cryo-EM结构、免疫球蛋白轻链等关键词。除上述结构主题信息外,源站未提供关于结构分辨率、纤维组成、原子坐标文件数量等更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于ebi.ac.uk,由欧洲蛋白质数据库(PDBe)发布,发布年份为2019年,对应DOI为10.2210/pdb/6hud/pdb,其结构条目编号可对应为6hud。数据对象的生物学来源为一名免疫球蛋白轻链型(AL)淀粉样变性患者的心脏淀粉样纤维。关于样本采集、制备与冷冻电镜成像的具体实验条件,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与分类,该数据集可服务于AL型淀粉样变性及心脏淀粉样纤维的结构研究,供关注免疫球蛋白轻链相关淀粉样沉积机制的研究者参考;同时因其归入循环系统疾病类别,也可作为循环系统疾病相关结构数据的组成部分用于检索与整合。关于该数据集在药物设计、临床诊断或其他具体应用中的用途,源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过DOI(10.2210/pdb/6hud/pdb)进行标识与访问,使用者可依据该DOI定位至欧洲蛋白质数据库(PDBe)中的对应条目。关于数据文件的下载格式、解析工具、可视化软件及具体使用步骤,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集由欧洲蛋白质数据库(PDBe)于2019年发布,具备明确的来源机构与DOI标识。其研究对象为单一患者的免疫球蛋白轻链型(AL)淀粉样变性心脏淀粉样纤维,样本范围有限。关于数据质量评估指标、结构验证结果、分辨率水平及使用中的其他限制,源站未提供。
【引用与许可】
引用该数据集时,可参照源站描述形式:Protein Data Bank in Europe (PDBe) (2019). Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibrils from an immunoglobulin light chain (AL) amyloidosis patient. [Dataset]. http://doi.org/10.2210/pdb/6hud/pdb。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
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无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pdbe/entry/pdb/6hud/biology
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Protein Data Bank in Europe (PDBe) (2019). Cryo-EM structure of cardiac amyloid fibrils from an immunoglobulin light chain (AL) amyloidosis patient. [Dataset]. http://doi.org/10.2210/pdb/6hud/pdb
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




