肠道微生物组的临床与遗传关联及其与心脏代谢风险的关系

人类肠道栖息着数万亿微生物,它们在健康中发挥动态作用。尽管微生物组通过调节宿主炎症和代谢对许多心脏代谢性状有贡献,但关于个体微生物影响心血管疾病(CVD)风险与发展的程度和机制,目前理解尚不完整

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基因组预测肠道微生物组心脏代谢风险心血管疾病临床表型遗传关联dbGaP
Clinical and Genetic Correlates of the Gut Microbiome and Relation to Cardiometabolic Risk

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-08
版本
3

资源简介

肠道微生物组的临床与遗传关联及其与心脏代谢风险的关系

该数据集英文名为“Clinical and Genetic Correlates of the Gut Microbiome and Relation to Cardiometabolic Risk”,在站内归入循环系统疾病 / 其他分类,来源站为 doi.org。数据集围绕人类肠道微生物组与心脏代谢风险之间的临床和遗传关联展开。人类肠道栖息着数万亿微生物,它们在健康中发挥动态作用;微生物组通过调节宿主炎症和代谢对许多心脏代谢性状有贡献,但关于个体微生物影响心血管疾病风险与发展的程度和机制,目前理解尚不完整。该数据集由 SHAW, STANLEY 提交,机构为 NHLBI BioData Catalyst,发布时间为 2025 年,目前可在 dbGaP 的“Authorized Access”区域获取,已提供的数据集之一为“Cholesterol Metabolism”。

【数据集背景】

人类肠道中的微生物数量庞大,并在维持健康方面扮演动态角色。现有认识表明,微生物组可通过调节宿主炎症和代谢,影响多种心脏代谢性状。然而,个体微生物究竟在多大程度上、通过何种机制影响心血管疾病的风险与发展,目前的理解仍不完整。该数据集正是在这一背景下,围绕肠道微生物组的临床与遗传相关因素及其与心脏代谢风险的关系而建立,旨在为探索微生物组与心血管疾病风险之间的关联提供数据基础。

【数据内容】

根据源站描述,该数据集目前提供的数据集之一为“Cholesterol Metabolism”,可在 dbGaP 的“Authorized Access”区域获取。数据集名称本身指向肠道微生物组的临床与遗传相关因素及其与心脏代谢风险的关系。关于数据的具体变量、样本量、组学层次、随访信息等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集与 Framingham Heart Study(FHS)相关。FHS 是一项多代观察性研究,数十年来持续随访参与者,通过将遗传和表型因素与临床结局相关联,识别心血管疾病的风险因素。作为一个具有广泛临床表型的大规模人群队列,FHS 为探索肠道微生物组与心脏代谢性状之间的关系提供了丰富的基础。数据集来源站为 doi.org,提交机构为 NHLBI BioData Catalyst,作者为 SHAW, STANLEY,发布时间为 2025 年。

【适用场景】

该数据集适用于探索肠道微生物组与心脏代谢性状及心血管疾病风险之间的关联,可用于研究个体微生物对心血管疾病风险与发展的潜在影响程度和机制,也可用于结合临床表型与遗传因素分析微生物组在宿主炎症和代谢调节中的作用。关于更具体的适用分析类型或研究设计,源站未提供。

【使用方法】

数据集可在 dbGaP 的“Authorized Access”区域获取。关于申请条件、访问流程、数据格式、分析工具及具体操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于 Framingham Heart Study 这一多代观察性队列,具有广泛临床表型和大规模人群基础。但源站同时指出,关于个体微生物影响心血管疾病风险与发展的程度和机制,目前理解尚不完整。关于数据质量评估、样本代表性、缺失情况及其他具体限制,源站未提供。

【引用与许可】

数据集作者为 SHAW, STANLEY,机构为 NHLBI BioData Catalyst,发布时间为 2025 年,来源站为 doi.org。关于引用格式、许可条款及使用限制的具体内容,源站未提供。

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源站:https://doi.org/10.60645/bdc-6qw5-2z6a

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人类肠道栖息着数万亿微生物,它们在健康中发挥着动态作用。尽管微生物组通过调节宿主炎症和代谢对许多心脏代谢特征有所贡献,但关于单个微生物影响心血管疾病(CVD)风险和发展的程度及机制,目前理解尚不完整。弗雷明汉心脏研究(FHS)是一项多代观察性研究,数十年来对参与者进行随访,通过将遗传和表型因素与临床结局相关联来识别CVD的风险因素。作为一个具有广泛临床表型分析的大规模人群队列,FHS为探索肠道微生物组与心脏代谢特征之间的关系提供了丰富的资源。可用数据集目前,我们在dbGaP的“授权访问”区域有以下数据集可用。1. 未培养的人类肠道细菌对胆固醇的代谢影响宿主胆固醇该数据集由来自624名FHS参与者的宏基因组FASTQ数据组成,与PMID:32544460一同发布。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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