PRJNA1035056:颅内动脉瘤患者肠道微生物组的变化

IA 形成与肠道菌群之间的关联仍不明确。因此,我们比较了 IA 患者与健康对照(HCs)的肠道微生物组,以识别与 IA 相关的特定细菌

ena
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其他分类肠道微生物组颅内动脉瘤感染性疾病病例对照健康对照细菌关联
PRJNA1035056: Alterations in gut microbiology in patients with intracranial aneurysms

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

PRJNA1035056:颅内动脉瘤患者肠道微生物组的变化

PRJNA1035056 数据集聚焦于颅内动脉瘤(intracranial aneurysm, IA)患者的肠道微生物组变化,其英文标题为“Alterations in gut microbiology in patients with intracranial aneurysms”。该数据集来源于 ebi.ac.uk,在本站归类为感染性疾病 / 其他。根据源站描述,颅内动脉瘤形成与肠道菌群之间的关联尚不明确,因此该研究通过比较 IA 患者与健康对照(healthy controls, HCs)的肠道微生物组,旨在识别与 IA 相关的特定细菌。数据集围绕这一比较设计,提供了从肠道微生物组层面探索颅内动脉瘤潜在相关菌群的研究材料,适合关注脑血管疾病与微生物组交叉领域的研究者参考使用。

【数据集背景】

颅内动脉瘤是一种脑血管病变,其形成机制涉及多种因素。源站描述指出,IA 形成与肠道菌群之间的关联仍不明确,这一不确定性构成了该数据集产生的研究背景。为探索二者之间可能存在的联系,研究设计将 IA 患者与健康对照的肠道微生物组进行比较,以期发现与 IA 相关的特定细菌。该数据集即围绕这一比较目的而建立,反映了从肠道微生物角度寻找 IA 相关生物学线索的研究方向。

【数据内容】

该数据集的核心内容是比较 IA 患者与健康对照(HCs)的肠道微生物组,以识别与 IA 相关的特定细菌。源站描述明确说明了比较对象和识别目标,但未提供样本数量、测序平台、序列类型、数据文件格式或具体菌群分类结果等细节。除上述比较设计外,源站未提供更细化的数据内容说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,英文名称为 PRJNA1035056: Alterations in gut microbiology in patients with intracranial aneurysms。源站描述说明了研究纳入 IA 患者与健康对照进行肠道微生物组比较,但未提供采样地点、采样时间、纳入排除标准、样本处理流程或测序方法等采集与来源信息。上述未提及的内容,源站未提供。

【适用场景】

基于源站描述,该数据集适用于研究颅内动脉瘤与肠道微生物组之间关联的场景,尤其是比较 IA 患者与健康对照肠道菌群差异、识别与 IA 相关的特定细菌等分析方向。它可用于脑血管疾病与微生物组交叉领域的探索性研究,也可作为相关比较研究的参考数据。需要说明的是,源站未提供该数据集在其他具体应用场景中的验证信息,因此适用场景应围绕其比较设计来理解。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件组织说明、分析流程或推荐工具等。使用者如需使用,应参考来源站 ebi.ac.uk 上该数据集对应的页面说明。除来源站信息外,此处不补充未提及的使用步骤。

【质量与限制】

源站描述仅说明研究比较了 IA 患者与健康对照的肠道微生物组以识别相关细菌,未提供样本量、数据完整性、测序质量、统计效力或潜在偏倚等质量相关信息。该数据集的主要限制在于:IA 形成与肠道菌群之间的关联本身尚不明确,研究属于探索性比较;源站也未提供可用于评估数据质量的具体指标。除上述内容外,质量与限制方面的其他信息源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在引用或再利用该数据集时,应查阅来源站 ebi.ac.uk 上对应数据集页面的最新说明,以获取准确的引用格式和许可条款。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA1035056

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IA形成与肠道菌群之间的关联仍不明确。因此,我们比较了IA患者与健康对照者(HCs)的肠道微生物组,以识别与IA相关的特定细菌。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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