数据来源：宿主转换与扩散驱动的亚马逊鸟类疟疾寄生虫多样性与分布

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.c1d1f8h

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数据集大小约 159.5 KB。

数据说明

理解病原体和寄生虫如何在时间和空间上多样化，是预测新发传染病的基础。在此，我们运用生物地理学、协同进化和系统发育分析，来描述地球上最多样化的鸟类群落中禽疟疾寄生虫的起源、多样性和分布。我们首先利用线粒体细胞色素b（cyt b）基因进行系统发育分析，以确定寄生虫谱系间的亲缘关系。随后，我们估算了分化时间并重建了祖先区域，以揭示景观演化如何塑造了亚马逊地区副血变形虫属（Parahaemoproteus）和疟原虫属（Plasmodium）的多样化。最后，我们评估了这一宿主-寄生虫系统中多样化的协同进化模式，以确定协同进化如何影响了禽疟疾寄生虫的当代多样性及其在亚马逊鸟类中的分布。对从4178只个体鸟中恢复的324个血孢子虫寄生虫谱系进行的生物地理学分析提供了强有力的证据，表明这些病原体能够轻易跨越亚马逊主要河流扩散，并且这种扩散在过去五百万年间发生得越来越频繁。

我们还在亚马逊地区的特有区域内发现了许多复制事件。对这些血液寄生虫及其鸟类宿主的共系统发育分析表明，其多样化历史主要由宿主转换主导。禽疟疾寄生虫在地理上扩散并在鸟类宿主间转换的能力，在其辐射演化中发挥了重要作用，并塑造了这些寄生虫在亚马逊地区的当前分布和多样性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。