T1D_microbiome 数据集

该数据集来自 data.mendeley.com,英文名为 T1D_microbiome,归类于内分泌系统疾病下的1型糖尿病

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2021-02-22 更新
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文本回归1型糖尿病肠道微生物组微生物丰度内分泌系统疾病CSV数据
T1D_microbiome

基本信息

模态
文本
大小
0.00036901 GB
任务类型
回归
创建/更新时间
2021-02-22
版本
v1

资源简介

T1D_microbiome 数据集

T1D_microbiome 是一个聚焦于1型糖尿病与微生物组关联的公开数据集,英文名称为 T1D_microbiome,归类于内分泌系统疾病下的1型糖尿病方向,来源于 data.mendeley.com。该数据集以单一文件形式提供患者微生物组丰度信息,文件名为 microbiome_abundances.csv,体积约 369.01 KB,采用 CSV 表格格式组织,便于使用常规表格工具或编程语言读取。数据集于 2021 年 2 月 22 日发布,版本为 v1,并配有 DOI 标识 10.17632/bcz47mhvc3.1,便于在学术引用中准确定位。整体而言,该数据集适合作为1型糖尿病相关微生物组研究的入门数据资源,用于了解患者微生物组丰度数据的组织形态与接入方式。

【数据集背景】

该数据集归属于内分泌系统疾病大类下的1型糖尿病方向。1型糖尿病是一种与胰岛素分泌相关的内分泌代谢疾病,其发生发展可能受到多种因素影响,微生物组是其中受到关注的研究方向之一。该数据集以患者微生物组丰度为内容主题,为相关领域的研究者提供了一个可直接获取的数据资源。数据集的英文名称 T1D_microbiome 直观体现了其主题指向,即1型糖尿病(T1D)与微生物组(microbiome)的结合。数据集发布于 data.mendeley.com,该平台为研究数据提供托管与共享服务,发布时间的记录为 2021 年 2 月 22 日,版本标记为 v1,表明这是该数据集的首个公开版本。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,文件样例为 microbiome_abundances.csv,合计约 369.01 KB。从文件名可以判断,文件内容为微生物组丰度数据,以 CSV 表格形式组织。CSV 是一种通用的纯文本表格格式,行与列之间以分隔符区分,便于被电子表格软件、统计软件以及各类编程语言直接读取。源站对该数据集的描述为“microbiome abundances of patients with t1d diabetes”,即1型糖尿病患者的微生物组丰度。关于表格中具体的字段名称、样本数量、微生物分类层级、丰度计量单位等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 data.mendeley.com,发布时间为 2021 年 2 月 22 日,版本为 v1,DOI 为 10.17632/bcz47mhvc3.1。源站描述表明其内容为1型糖尿病患者的微生物组丰度。关于样本采集地点、采集时间跨度、受试者招募方式、测序平台或实验方法等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于1型糖尿病与微生物组相关的研究探索,例如了解患者微生物组丰度数据的表格组织方式、作为微生物组分析流程的输入数据、或在方法学研究中用于演示数据读取与预处理步骤。由于数据以 CSV 格式提供,适合在电子表格工具中进行初步浏览,也适合在统计或编程环境中进行批量处理。关于该数据集是否适用于特定类型的统计分析或机器学习建模,源站未提供明确说明。

【使用方法】

使用该数据集时,可先下载数据文件 microbiome_abundances.csv,文件体积约 369.01 KB。随后按 CSV 表格格式读取数据。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再进行批量接入,以避免因编码或分隔符问题导致读取错误。关于字段的具体含义、编码方式以及是否存在缺失值处理约定,源站未提供,因此在实际使用中需要结合数据文件本身进行核对。

【质量与限制】

该数据集为 v1 版本,包含单一 CSV 文件,体积约 369.01 KB。关于数据完整性、样本量、缺失值情况、测量误差、批次效应等质量相关指标,源站未提供。由于数据集仅包含一个文件,其覆盖范围与深度可能有限,使用者在将其用于研究结论推导时应保持谨慎。关于数据是否经过同行评审或质量控制流程,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集配有 DOI 标识 10.17632/bcz47mhvc3.1,版本为 v1,发布于 2021 年 2 月 22 日,来源为 data.mendeley.com。在学术使用中可通过该 DOI 进行引用与定位。关于该数据集的具体许可条款、使用限制以及推荐的引用格式,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://data.mendeley.com/datasets/bcz47mhvc3/1

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 369.0 KB。

数据说明

Anastasia Godneva (2021). T1D_microbiome [Dataset]. http://doi.org/10.17632/bcz47mhvc3.1

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