基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-22

资源简介

ERBB4激动剂JK07减轻小鼠和迷你猪心房重构及房颤诱发性的数据集

GSE255166 数据集来自 NCBI GEO，围绕 ERBB4 激动剂 JK07 对心房重构及心房颤动诱发性的影响展开，研究同时涉及小鼠与迷你猪模型。数据集收录了迷你猪左心耳样本的高通量测序 mRNA 转录谱数据，样本涵盖 DOCA 诱导组、DOCA 联合 JK07 处理组以及对照（vehicle）样本。其核心目的在于通过转录组层面的测量，刻画心房颤动所伴随的心肌细胞转录谱变化，并将这些变化与采样时获取的心房颤动生理表型相关联。数据集以单个系列矩阵文件形式提供，属于心血管系统疾病中心房颤动方向的基础研究型表达谱资源。

【数据集背景】

心房颤动是常见的心血管系统疾病，其发生发展常伴随心房结构重构与电重构。源站描述指出，该研究旨在建立由心房颤动引起的心肌细胞转录谱变化，通过对比不同处理条件下迷你猪左心耳组织的 mRNA 表达特征，探索心房颤动相关的分子层面改变。研究关注 ERBB4 激动剂 JK07 在减轻心房重构与降低心房颤动诱发性方面的作用，实验设计覆盖小鼠与迷你猪两类动物模型，其中转录谱数据来自迷你猪左心耳样本。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Expression profiling by high throughput sequencing，即基于高通量测序的表达谱分析；涉及 GPL26351 平台与物种编号 9823（猪）。数据内容为迷你猪左心耳样本中 mRNA 的转录谱，样本包括 DOCA 诱导、DOCA 联合 JK07 处理以及 vehicle 对照三类。数据集文件数量为 1，文件样例为 GSE255166_series_matrix.txt.gz，即系列矩阵文件，通常以矩阵形式组织样本与表达测量结果。源站描述提到，这些样本的转录谱将采用高通量技术测量，转录谱变化可与采样时获得的心房颤动生理表型进行关联分析。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov（NCBI GEO）。样本取自迷你猪的左心耳，实验分组包括 DOCA 诱导组、DOCA 与 JK07 联合处理组以及 vehicle 对照组。作者为 Jens，van Fraeyenhove，发布时间为 Feb 06 202。源站描述说明，采集左心耳样本的目的是建立心房颤动引起的心肌细胞转录谱变化，并将转录谱与收获时获取的心房颤动生理表型相关联。

【适用场景】

该数据集适用于心血管系统疾病尤其是心房颤动方向的研究，可用于考察心房颤动相关的心肌细胞转录谱改变，比较 DOCA 诱导、DOCA 联合 JK07 处理与对照条件下左心耳 mRNA 表达特征的差异，并支持将转录组变化与心房颤动生理表型进行关联分析的探索。其高通量测序表达谱属性也使其可用于猪（物种编号 9823）相关转录组数据的参考与整合研究。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE255166_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以便后续分析流程稳定运行。

【质量与限制】

源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE255166

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE255166

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为确定心房颤动引起的心肌细胞转录谱变化，我们采集了经DOCA或DOCA联合JK07诱导的迷你猪的左心耳样本以及溶媒对照样本。将采用高通量技术测定这些样本中mRNA的转录谱。转录谱的变化可与取材时获得的心房颤动生理特征进行相关性分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别