水蛭素干预的动脉粥样硬化小鼠主动脉组织与RAW264.7细胞转录组数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.57760/sciencedb.014yf

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集为动脉粥样硬化（AS）转录组学研究的论文关联数据，包含体内小鼠模型和体外细胞模型实验的基因表达定量结果。体内实验：采用Mus musculus建立AS小鼠模型。动物分为空白对照组（CK）、模型组（AS）和高剂量水蛭素治疗组（HIR），每组3个生物学重复，共9份主动脉组织样本。体外实验：采用小鼠巨噬细胞系RAW264.7建立AS细胞模型。细胞分为对照组（Col）、模型组（Model）和高剂量水蛭素治疗组（HIR），每组3个生物学重复，共9份细胞样本。从组织和细胞样本中提取总RNA，随后进行文库构建，并在Illumina平台上进行双端测序。原始数据经过质控、比对和定量处理，生成基因表达矩阵。（1）文件1 animal_expression_matrix.xlsx：动物组织样本的表达矩阵。

第一列为gene_id，其后9列依次为CK_1至HIR_3；（2）文件2 cell_expression_matrix.xlsx：细胞样本的表达矩阵。第一列为gene_id，其后9列依次为Col_1至HIR_3。数值表示基因表达水平，单位为FPKM。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。