颅内动脉瘤中周期性牵张中断的影响:内皮细胞转录组数据集
该数据集来自 Mendeley Data,聚焦颅内动脉瘤中周期性牵张中断对内皮细胞转录组的影响。数据包含 HUVECs 在生理性与动脉瘤性周期性牵张下的差异表达基因结果,以及相应的基因集富集分析结果

基本信息
资源简介
颅内动脉瘤中周期性牵张中断的影响:内皮细胞转录组数据集
该数据集聚焦颅内动脉瘤中周期性牵张中断对内皮细胞转录组的影响,来源于 Mendeley Data,发布年份为 2023。数据集围绕人脐静脉内皮细胞(HUVECs)在生理性与动脉瘤性周期性牵张条件下的基因表达变化展开,包含差异表达基因分析结果以及基因集富集分析结果。其核心价值在于从转录组层面揭示内皮细胞在异常机械力学环境下的分子响应,为理解颅内动脉瘤的发病机制提供数据支撑。数据集主题标签涵盖 RNA Sequencing、Transcriptome 与 Differential Gene Expression,属于心血管系统疾病中动脉瘤方向的基础研究数据资源,适合从事血管生物学、力学信号转导及动脉瘤机制研究的科研人员参考使用。
【数据集背景】
颅内动脉瘤的发生与发展涉及血流动力学因素与血管壁细胞生物学行为的复杂交互。内皮细胞作为血管壁与血流直接接触的细胞类型,对机械力学刺激高度敏感。周期性牵张是血管内皮细胞在体环境中持续经历的力学形式之一,当这一力学模式因动脉瘤形成而发生中断或改变时,内皮细胞的转录程序可能随之发生显著变化。该数据集正是针对这一科学问题,通过体外模拟生理性与动脉瘤性周期性牵张条件,对人脐静脉内皮细胞进行转录组层面的比较分析,以期获得与颅内动脉瘤相关的内皮细胞差异表达基因和富集通路信息。该数据集所属分类为心血管系统疾病 / 动脉瘤,来源站为 doi.org。
【数据内容】
该数据集的核心内容由两部分构成。第一部分为补充表 1,即 HUVECs 在生理性与动脉瘤性周期性牵张下差异表达基因的结果。第二部分为补充表 2,即 HUVECs 在生理性与动脉瘤性周期性牵张下基因集富集分析的结果。这两部分内容共同构成了从单基因差异到基因集层面功能倾向的完整转录组分析框架。数据集主题标签包括 RNA Sequencing、Transcriptome 和 Differential Gene Expression,表明其数据类型属于 RNA 测序相关的转录组数据,分析重点在于差异基因表达。除上述补充表所涵盖的内容外,源站未提供更多关于数据文件格式、字段结构或数据量的具体说明。
【采集与来源】
该数据集由 DIAGBOUGA, Mannekomba、Lemeille, Sylvain、Morel, Sandrine 与 Kwak, Brenda R 共同完成,机构来源为 Mendeley Data,发布时间为 2023 年,来源站为 doi.org。实验对象为人脐静脉内皮细胞(HUVECs),实验处理条件为生理性与动脉瘤性周期性牵张的对比。关于具体的细胞培养条件、牵张参数、测序平台、测序深度、生物学重复数量以及数据分析流程等实验细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于以下研究方向:颅内动脉瘤发病机制中内皮细胞力学响应相关的转录组分析;周期性牵张改变条件下内皮细胞差异表达基因的筛选与验证;基因集富集分析结果的二次挖掘与通路层面的功能解释;心血管系统疾病尤其是动脉瘤相关生物标志物或治疗靶点的前期发现研究;以及 RNA Sequencing 和 Transcriptome 相关方法学比较或整合分析。该数据集亦可作为内皮细胞力学生物学研究中的参考数据资源,用于与其他血管内皮细胞转录组数据集进行交叉比较。但具体适用性需结合研究者自身的研究问题和分析设计加以判断。
【使用方法】
使用者可依据补充表 1 获取 HUVECs 在生理性与动脉瘤性周期性牵张下的差异表达基因结果,并依据补充表 2 获取相应的基因集富集分析结果。在具体使用中,可对差异表达基因进行筛选、聚类或功能注释,也可结合基因集富集分析结果识别在动脉瘤性牵张条件下显著富集或抑制的生物学通路。若需将本数据集与其他转录组数据整合,应注意实验条件、细胞类型和分析方法的可比性。关于数据下载方式、文件格式、是否提供原始测序数据或分析代码等具体使用信息,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 Mendeley Data,来源站为 doi.org,发布年份为 2023 年,具备明确的作者信息和主题标签。其数据内容以补充表形式呈现,涵盖差异表达基因结果和基因集富集分析结果,结构相对清晰。然而,该数据集基于人脐静脉内皮细胞(HUVECs)这一体外细胞模型,与颅内动脉瘤原位内皮细胞在微环境、细胞异质性和力学条件等方面可能存在差异,因此结论的外推需谨慎。此外,关于样本量、重复性、统计阈值、测序质量参数及验证实验等信息,源站未提供,使用者在解释结果时应充分考虑这些潜在限制。
【引用与许可】
该数据集的作者为 DIAGBOUGA, Mannekomba、Lemeille, Sylvain、Morel, Sandrine 与 Kwak, Brenda R,机构为 Mendeley Data,发布年份为 2023 年,来源站为 doi.org。数据集英文名称为 Impact of disrupted cyclic stretch in intracranial aneurysms: insights from endothelial cell transcriptomic dataset。关于具体的引用格式、许可协议类型、使用限制或版权声明等信息,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.17632/wkxnrfbzzc.1
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 35.8 KB。
数据说明
Supplementary Table 1: Differentially expressed genes results of HUVECs exposed to physiological vs aneurysmal cyclic stretch Supplementary Table 2: Gene set enrichment analysis of HUVECs exposed to physiological vs aneurysmal cyclic stretch
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