HLA class II相关C1Q巨噬细胞状态与腹主动脉瘤APOE/SPP1基质耦联的源数据与分析代码
该数据集为一项整合单细胞与多队列转录组研究的配套源数据与分析代码，研究聚焦腹主动脉瘤中HLA class II相关的C1Q巨噬细胞状态及APOE/SPP1基质耦联
基本信息
资源简介
HLA class II相关C1Q巨噬细胞状态与腹主动脉瘤APOE/SPP1基质耦联的源数据与分析代码
Source data and analysis code for an HLA class II-associated C1Q macrophage state and distinct APOE/SPP1 stromal coupling in abdominal aortic aneurysm
该数据集为一项整合单细胞与多队列转录组研究的配套源数据与分析代码，研究聚焦腹主动脉瘤中HLA class II相关的C1Q巨噬细胞状态及APOE/SPP1基质耦联。数据整合两套独立分析的人单细胞RNA测序数据集与四个bulk转录组队列，涵盖主图与补充图的源数据、处理数据、分析代码、参数登记表及审计材料。可用于复现巨噬细胞状态异质性与巨噬细胞-基质转录耦联相关分析，并区分HLA-II/CIITA相关C1Q抗原呈递状态、APOE-LRP1脂质处理背景及SPP1-CD44/整合素重塑程序（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2026-08-02。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该仓库包含支持题为“An HLA class II-associated C1Q macrophage state and distinct APOE/SPP1 stromal coupling in abdominal aortic aneurysm: an integrative single-cell and multi-cohort transcriptomic study”研究的处理数据、分析代码、参数登记表、源表、图源数据及审计材料。该研究整合两个独立分析的人单细胞RNA测序数据集与四个bulk转录组队列，以表征腹主动脉瘤中的巨噬细胞状态异质性与巨噬细胞-基质转录耦联。分析区分了一种HLA-II/CIITA相关的C1Q抗原呈递状态、一个更广泛的APOE-LRP1脂质处理背景以及一个亚群富集的SPP1-CD44/整合素重塑程序。该仓库包括：1. 最终主图与补充图文件及其源数据。2. 完整
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 37.73 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.33137450.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Cardiovascular medicine and haematology not elsewhere classified、Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified。主题标签：abdominal aortic aneurysm, AAA growth、macrophage activation efficiency、HLA Class II Antigens。本站分类：心血管系统疾病/腹主动脉瘤。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cardiovascular medicine and haematology not elsewhere classified、Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Source_data_and_analysis_code_for_an_HLA_class_II-associated_C1Q_macrophage_state_and_distinct_APOE_SPP1_stromal_coupling_in_abdominal_aortic_aneurysm/33137450
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Zhao, Kaixun (2026). Source data and analysis code for an HLA class II-associated C1Q macrophage state and distinct APOE/SPP1 stromal coupling in abdominal aortic aneurysm. figshare. Dataset
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Source data and analysis code for an HLA class II-associated C1Q macrophage state and distinct APOE/SPP1 stromal coupling in abdominal aortic aneurysm
- DOI：10.6084/m9.figshare.33137450.v1
- 发布日期：2026-08-02
- 文件数：1 个
- 文件总体积：37.73 MB
- 源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Source_data_and_analysis_code_for_an_HLA_class_II-associated_C1Q_macrophage_state_and_distinct_APOE_SPP1_stromal_coupling_in_abdominal_aortic_aneurysm/33137450
命令行下载
curl -L -o "HLAII_AAA_Crosstalk_Figshare_Upload_v1_2_FinalSensitivity.zip" "https://ndownloader.figshare.com/files/67177634"
文件清单
HLAII_AAA_Crosstalk_Figshare_Upload_v1_2_FinalSensitivity.zip（37.73 MB）
文件总体积 37.73 MB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
本仓库包含支持题为“腹主动脉瘤中HLA II类相关的C1Q巨噬细胞状态及独特的APOE/SPP1基质耦合：一项整合性单细胞与多队列转录组研究”的研究的 processed data、分析代码、参数注册表、源表、图源数据及审计材料。
该研究整合了两个独立分析的人单细胞RNA测序数据集与四个 bulk 转录组队列，以刻画腹主动脉瘤中巨噬细胞状态的异质性及巨噬细胞-基质转录耦合。分析区分了一种HLA-II/CIITA相关的C1Q抗原呈递状态、一个更广泛的APOE-LRP1脂质处理背景，以及一个亚群富集的SPP1-CD44/整合素重塑程序。
本仓库包括：
- 最终主图与补充图文件及其源数据。
- 完整的补充数据表及衍生分析结果。
- 用于质量控制、谱系分析、LIANA通讯推断、NicheNet配体优先级排序、bulk转录组投影及meta分析的版本化R脚本。
- 患者层面与队列层面的敏感性分析。
- 校正评分共线性诊断及无候选配体的纯炎症耦合分析。
- 采用10/3、20/5和30/10细胞支持设置的LIANA患者支持阈值分析。
- 采用20%、25%和30%患者内评分尾部的NicheNet接收者评分敏感性分析。
- 可复现性清单、决策记录、会话信息及SHA256文件校验和。
最终敏感性分析显示，所有六个预设的配体-受体轴在LIANA阈值设置下均保留了其排名支持类别。在所有接收者程序分位数设置下，SPP1始终位居排名最高的候选配体之列，而无候选配体的炎症校正则保留了SPP1、APOE和C1QB的整体耦合层级。
提供这些材料是为了支持透明度、可重复性和独立评估。推断的配体-受体路径和组织水平的相关性代表的是转录组关联，并不构成直接证据。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.33137450.v1（source: https://figshare.com/articles/dataset/Source_data_and_analysis_code_for_an_HLA_class_II-associated_C1Q_macrophage_state_and_distinct_APOE_SPP1_stromal_coupling_in_abdominal_aortic_aneurysm/33137450）。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
