腹主动脉瘤中HLA-II相关巨噬细胞状态的多层次计算机扰动与空间情境化可重复性档案
该数据集是腹主动脉瘤研究的可重复性档案，包含版本化分析脚本、冻结的基因与模块定义、供体与数据集清单、机器可读的衍生结果、计算环境与溯源记录及文档
基本信息
资源简介
腹主动脉瘤中HLA-II相关巨噬细胞状态的多层次计算机扰动与空间情境化可重复性档案
Reproducibility archive for multi-level in silico perturbation and spatial contextualization of the HLA-II-associated macrophage state in abdominal aortic aneurysm
该数据集是腹主动脉瘤研究的可重复性档案，包含版本化分析脚本、冻结的基因与模块定义、供体与数据集清单、机器可读的衍生结果、计算环境与溯源记录及文档。支持的工作流涵盖 scTenifoldKnk 网络扰动、CellOracle 状态转换建模、Geneformer 零样本扰动、小鼠 Seq-Scope 空间情境化、DrugReflector 化合物优先级排序以及 TBXA2R 结构对接与重对接质控，可用于复现该研究的主要分析（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2026-08-24。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该仓库包含支持题为“多层次计算机扰动与空间情境化界定腹主动脉瘤中HLA-II相关巨噬细胞状态的有限单因素可控性与药理可塑性”研究的可重复性材料。档案包括版本化分析脚本、冻结的基因与模块定义、供体与数据集清单、机器可读的衍生结果、计算环境与溯源记录，以及复现主要分析所需的文档。所支持的工作流包括 scTenifoldKnk 网络扰动、CellOracle 状态转换建模、Geneformer 零样本扰动、小鼠 Seq-Scope 空间情境化、DrugReflector 化合物优先级排序，以及 TBXA2R 结构对接与重对接质量控制。该研究区分了网络可扰动性、whole-st
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 11.14 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.33322533.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Translational and applied bioinformatics。主题标签：Aortic aneuryam、HLA II genes。本站分类：心血管系统疾病/腹主动脉瘤。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Translational and applied bioinformatics。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Reproducibility_archive_for_multi-level_in_silico_perturbation_and_spatial_contextualization_of_the_HLA-II-associated_macrophage_state_in_abdominal_aortic_aneurysm/33322533
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Zhao, Kaixun (2026). Reproducibility archive for multi-level in silico perturbation and spatial contextualization of the HLA-II-associated macrophage state in abdominal aortic aneurysm. figshare. Dataset
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.33322533.v1
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 11.1 MB。
数据说明
本仓库包含支持题为“多水平计算机扰动与空间情境化界定腹主动脉瘤中HLA-II相关巨噬细胞状态的有限单因素可控性与药理学可塑性”研究的可重复性材料。该存档包括版本化分析脚本、冻结的基因与模块定义、供体与数据集清单、机器可读的衍生结果、计算环境与溯源记录，以及复现主要分析所需的文档。所支持的工作流程包括scTenifoldKnk网络扰动、CellOracle状态转移建模、Geneformer零样本扰动、小鼠Seq-Scope空间情境化、DrugReflector化合物优先级排序，以及TBXA2R结构对接与再对接质量控制。该研究区分了网络可扰动性、全状态可控性、基础模型敏感性、空间情境、药理学投射和结构兼容性。
所存放的结果支持计算分析的可重复性，但不应被解读为治疗有效性、靶点结合、结合亲和力或经实验验证的状态转换的证据。研究中使用的公共来源数据集和结构仍可从其原始存储库获取，包括GEO登录号GSE237230、GSE166676和GSE229500，以及蛋白质数据库结构6IIU和6IIV。因此，本档案不再分发原始第三方数据和模型检查点。渲染的出版图随相关手稿单独提交；在适用的情况下，包含了图生成脚本和机器可读的源数据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
