腹主动脉瘤遗传锚定多组学靶点优先级数据与代码
该数据集为腹主动脉瘤遗传锚定多组学靶点优先级研究提供处理后的数据、衍生证据表、分析代码、图表源数据、最终图表及审计溯源材料
基本信息
资源简介
腹主动脉瘤遗传锚定多组学靶点优先级数据与代码
Data and code for: Genetically Anchored Multi-Omics Prioritization Links PLTP and MMP12 to HLA-II/Lipid-Handling and SPP1-Remodeling Macrophage States in Abdominal Aortic Aneurysm
该数据集为腹主动脉瘤遗传锚定多组学靶点优先级研究提供处理后的数据、衍生证据表、分析代码、图表源数据、最终图表及审计溯源材料。研究在腹主动脉瘤中实施预设的遗传学到细胞状态靶点优先级框架，基于冻结的107个基因候选集，整合靶点级遗传锚定、人类疾病转录组证据、巨噬细胞状态与患者级支持、受控扰动证据、跨队列复制、可成药性/可追踪性信息及安全性/必需性惩罚，最终突出PLTP与MMP12等候选。数据可用于复现分析、验证靶点优先级结果及开展相关方法学研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2026-08-17。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该存储库包含支持手稿《Genetically Anchored Multi-Omics Prioritization Links PLTP and MMP12 to HLA-II/Lipid-Handling and SPP1-Remodeling Macrophage States in Abdominal Aortic Aneurysm》的处理后数据、衍生证据表、分析代码、图表源数据、最终图表以及审计/溯源材料。该研究在腹主动脉瘤（AAA）中实施了一个预设的遗传学到状态靶点优先级框架。使用靶点级遗传锚定、人类疾病转录组证据、巨噬细胞细胞状态与患者级支持、受控扰动证据、跨队列复制、可成药性/可追踪性信息以及安全性/必需性惩罚，对一个冻结的107个基因候选集进行了评估。最终优先级排序突出PLTP作为一个遗传锚定的多域候选，与HLA-II/脂质处理相关
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 11.57 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.33270981.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Cardiology (incl. cardiovascular diseases)、Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified。主题标签：Abdominal aortic aneurysm screening、Target Prioritization、HLA class II genes coding。本站分类：心血管系统疾病/腹主动脉瘤。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cardiology (incl. cardiovascular diseases)、Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Data_and_code_for_Genetically_Anchored_Multi-Omics_Prioritization_Links_PLTP_and_MMP12_to_HLA-II_Lipid-Handling_and_SPP1-Remodeling_Macrophage_States_in_Abdominal_Aortic_Aneurysm/33270981
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Zhao, Kaixun (2026). Data and code for: Genetically Anchored Multi-Omics Prioritization Links PLTP and MMP12 to HLA-II/Lipid-Handling and SPP1-Remodeling Macrophage States in Abdominal Aortic Aneurysm. figshare. Dataset
下载信息
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源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.33270981.v1
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 11.6 MB。
数据说明
本仓库包含经过处理的数据、衍生证据表、分析代码、图源数据、最终图表以及审计/溯源材料，用以支持手稿《遗传锚定的多组学优先级排序将PLTP和MMP12与腹主动脉瘤中的HLA-II/脂质处理及SPP1-重塑巨噬细胞状态相关联》。该研究在腹主动脉瘤（AAA）中实施了一个预先设定的从遗传学到状态的靶点优先级排序框架。使用靶点水平的遗传锚定、人类疾病转录组证据、巨噬细胞状态与患者水平支持、受控扰动证据、跨队列复制、可成药性/可追踪性信息以及安全性/必需性惩罚，对一个冻结的107个基因候选集合进行了评估。最终优先级排序突出显示PLTP为一个遗传锚定的多结构域候选基因，与HLA-II/脂质处理巨噬细胞状态相关；MMP12为一个更强但受背景限制的遗传锚点，优先与SPP1-重塑巨噬细胞状态相关。
HLA-II核心被保留为一个独立的MHC相关巨噬细胞程序轴。该Figshare记录包含机器可读的主表和补充表、完整的版本化R分析工作流、最终的主图和补充图、图表生成脚本及源数据、排序敏感性分析、共定位和SuSiE诊断输出、巨噬细胞状态分析，以及重建所报告结果所需的审计/会话信息文件。该存储库仅包含经过处理和衍生的输出结果。原始或受控的第三方基因组和转录组数据集不再分发。原始资源仍可从各自存储库获取，并在随附的资源清单中按登录号和来源予以记录。本研究中的遗传锚定代表预先指定的顺式调控和共定位证据，不应被解释为经精细定位确认的表达介导的c
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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