动物发育中遗传缺陷由再生程序缓冲的数据
该数据集来自 Dryad，围绕斑马鱼再生过程中遗传缺陷的缓冲机制展开。研究利用携带 fgf20a 报告基因的转基因斑马鱼，通过 ENU 诱变筛选影响再生相关基因激活的突变，在鳍褶截肢后评估 fgf20a 报告基因表达变化，发现一株在无损伤时即出现可遗传的 fgf20a:EGFP 升高，且局限于发生退
基本信息
资源简介
动物发育中遗传缺陷由再生程序缓冲的数据
Data from: Buffering of genetic defects in animal development by regeneration programs
该数据集来自 Dryad，围绕斑马鱼再生过程中遗传缺陷的缓冲机制展开。研究利用携带 fgf20a 报告基因的转基因斑马鱼，通过 ENU 诱变筛选影响再生相关基因激活的突变，在鳍褶截肢后评估 fgf20a 报告基因表达变化，发现一株在无损伤时即出现可遗传的 fgf20a:EGFP 升高，且局限于发生退化的鳍褶组织。全基因组测序定位到 fraser syndrome 1 基因 exon 72 内的突变。数据可用于再生、发育及先天缺陷相关研究（来源 DOI 解析，Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：再生程序使动物能够恢复受损或丢失的组织，而触发这些程序的刺激范围尚未被完全了解。在此，我们使用具有非凡再生能力的脊椎动物斑马鱼，来鉴定改变再生相关基因激活的化学诱导突变。将带有允许性启动子和 EGFP 盒插入促再生因子基因 fgf20a 附近的转基因斑马鱼进行诱变，并对 ENU 诱导突变的纯合幼虫在鳍褶截肢后评估 fgf20a 指导的报告基因表达中断情况。鉴定出一个品系，其在无实验损伤情况下具有可遗传的、升高的 fgf20a:EGFP 存在，且局限于正在发生退化的鳍褶组织区域。全基因组测序（WGS）鉴定出 fraser syndrome 1（fras
【主题与分类】
主题标签：Regeneration、development、congenital defects、Zebrafish。本站分类：损伤、中毒及外因。
【获取与许可】
源站页面：https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.jdfn2z3sm
使用许可：Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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源站：https://doi.org/10.5061/dryad.jdfn2z3sm
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 11.39 GB。
数据说明
再生程序使动物能够修复受损或丢失的组织，而这些程序的刺激因素范围尚未被完全了解。在此，我们利用斑马鱼——一种具有非凡再生能力的脊椎动物——来鉴定改变再生相关基因激活的化学诱导突变。将含有允许性启动子和EGFP盒插入促再生因子基因fgf20a附近的转基因斑马鱼进行诱变，并对携带ENU诱导突变纯合子的幼鱼在鳍褶截肢后评估fgf20a引导的报告基因表达中断情况。鉴定出一株系，在无实验性损伤的情况下具有可遗传的fgf20a:EGFP表达升高，局限于正在退化的鳍褶组织区域。全基因组测序（WGS）鉴定出fraser综合征1（fras1）基因第72外显子内的一个突变，该基因在遗传性皮肤病患者中发生突变。
fras1突变体幼鱼自发地在鳍褶中显示出其他已知损伤/再生响应报告基因品系的表达升高，而针对人类发育疾病中其他突变基因同源物的斑马鱼crispants也在畸形区域显示出再生相关基因的表达。通过在fras1突变体中转基因表达显性负性Fgf受体来缓和Fgf信号传导，加剧了疾病表型。我们的发现提供了证据，表明再生程序在应对由遗传突变引起的发育缺陷时被利用，可能缓冲有害表型。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
