健康活体供肾单细胞数据集
该数据集来自 CZ CELLxGENE,收录 19 例健康活体供肾样本,均采用 10X v3 试剂进行 scRNAseq,其中 10 例样本经过 CD45+ 富集

基本信息
资源简介
健康活体供肾单细胞数据集
Healthy living donor kidney 数据集收录于 CZ CELLxGENE 平台,聚焦健康活体供肾来源的单细胞转录组数据。该数据集共包含 19 例活体供肾样本,全部采用 10X v3 试剂进行 scRNAseq 测序,其中 10 例样本经过 CD45+ 富集处理。样本对应组织为肾脏皮质,疾病状态标注为正常(normal)。数据集在本站归入泌尿生殖系统疾病 / 其他分类,主题标签为 normal。整体而言,该数据集为研究正常肾脏组织、尤其是健康供肾来源的细胞组成与转录特征提供了单细胞层面的资源。
【数据集背景】
该数据集来自 CZ CELLxGENE 平台,属于单细胞转录组数据集。其研究对象为健康活体供肾,疾病状态为正常,组织来源为肾脏皮质。在泌尿生殖系统疾病 / 其他这一分类下,该数据集以正常样本为主题标签,可用于建立健康肾脏组织的参照基线。由于样本来自活体供肾,且全部经过 10X v3 试剂处理,数据在测序平台与试剂版本上具有较好的一致性,便于在同一技术条件下进行样本间比较。
【数据内容】
数据集包含 19 例活体供肾样本,均采用 10X v3 试剂进行 scRNAseq。其中 10 例样本经过 CD45+ 富集,这意味着这部分样本在免疫细胞相关转录本的捕获上可能具有更高的相对比例。样本组织为肾脏皮质,疾病状态为正常。数据集为单细胞数据集,来源站为 cellxgene.cziscience.com。除上述信息外,源站未提供关于细胞数量、基因数量、细胞类型注释、测序深度、聚类结果等更细粒度的数据内容描述。
【采集与来源】
样本来源为活体供肾,共 19 例。所有样本均使用 10X v3 试剂进行 scRNAseq,组织取材部位为肾脏皮质。10 例样本进行了 CD45+ 富集处理,其余样本的处理方式源站未提供。数据集的来源站为 cellxgene.cziscience.com。关于供者年龄、性别、种族、地理来源、伦理审批信息、样本采集时间等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于正常肾脏皮质组织的单细胞转录组研究,可作为健康对照或基线参考,用于与疾病状态下的肾脏样本进行比较分析。由于包含 CD45+ 富集样本,也可用于关注肾脏免疫细胞组成的研究场景。此外,该数据集可用于评估 10X v3 试剂在活体供肾样本中的表现,或用于单细胞数据整合、细胞类型鉴定等方法学探索。需要说明的是,具体适用场景应结合源站提供的数据说明与使用条款确定,源站未提供更详细的适用建议。
【使用方法】
该数据集托管于 CZ CELLxGENE 平台,可通过 cellxgene.cziscience.com 访问。关于数据下载格式、文件结构、是否需要专用工具、是否提供在线可视化浏览器、是否支持按细胞类型或样本筛选等具体使用方法,源站未提供。用户应参考源站提供的说明文档与数据访问界面进行操作。
【质量与限制】
该数据集样本量较小,共 19 例,其中 10 例经过 CD45+ 富集,可能影响不同样本之间细胞组成的直接可比性。所有样本均采用 10X v3 试剂进行 scRNAseq,技术平台一致,但源站未提供测序质量指标、细胞存活率、双细胞率、批次信息等质量控制数据。此外,源站未提供关于样本处理、建库、测序深度、数据过滤标准等细节。因此,在使用该数据集时,应关注其样本量有限以及 CD45+ 富集带来的组成偏倚等潜在限制。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制、是否允许商业用途、是否需要署名等,源站未提供。用户在使用前应查阅 CZ CELLxGENE 平台及数据集页面上的相关说明,以确认引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://cellxgene.cziscience.com/collections/dc3a5256-5c39-4a21-ac0c-4ede3e7b2323
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
19名活体供者,所有样本均使用10X v3试剂盒进行scRNAseq处理。其中10个样本进行了CD45+富集。疾病:正常。组织:肾脏皮质。检测方法:10x 3’ v3。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




