妊娠5周宫颈管滋养层细胞非侵入性分离后的胎儿基因组分析
该数据集来自 search.dataone.org，主题为妊娠5周起经宫颈管非侵入性分离完整滋养层细胞后进行胎儿基因组分析
基本信息
资源简介
妊娠5周宫颈管滋养层细胞非侵入性分离后的胎儿基因组分析
Fetal genome profiling at 5 weeks of gestation after noninvasive isolation of trophoblast cells from the endocervical canal
该数据集来自 search.dataone.org，主题为妊娠5周起经宫颈管非侵入性分离完整滋养层细胞后进行胎儿基因组分析。源站描述指出，单基因突变涉及6000多种疾病、占儿科住院10%和婴儿死亡20%，唐氏综合征等非整倍体在全球出生中占比超过0.2%且随高龄生育上升；现有产前诊断依赖侵入性取材或游离胎儿DNA检测，均受限于孕早期不可用或胎儿DNA比例低。研究在妊娠5至19周经巴氏涂片非侵入性采集滋养层细胞，对20例匹配母体、胎盘和胎儿样本进行靶向测序（来源 DataONE，CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：单基因突变导致6000多种疾病，占所有儿科住院的10%和婴儿死亡的20%。唐氏综合征和其他非整倍体在全球超过0.2%的出生中发生，并因高龄生育而呈上升趋势。遗传源性出生缺陷可在侵入性提取胎儿组织后在宫内诊断。使用循环游离胎儿DNA的非侵入性检测受限于较低的胎儿DNA比例。这两种方式在妊娠早期结束前均不可用。我们从妊娠5至19周非侵入性采集的巴氏涂片中分离出完整滋养层细胞，用于胎儿DNA的下一代测序。对连续匹配的母体、胎盘和胎儿样本（n = 20）通过多重靶向DNA测序进行了分析，覆盖全部24条染色体上的59个短串联重复位点和94个单核苷酸变异位点。
【主题与分类】
主题标签：genome profiling、TRIC、noninvasive、trophoblast。本站分类：妊娠、分娩和产褥期。
【获取与许可】
源站页面：https://search.dataone.org/view/sha256%3A7573027f3e045540a2337f705ba2bc7e798d11225c2588272c263db49f64de8a
使用许可：CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
单基因突变导致6000多种疾病，占所有儿科住院病例的10%，占婴儿死亡的20%。唐氏综合征及其他非整倍体异常在全球超过0.2%的出生中发生，且因高龄生育而呈上升趋势。遗传性出生缺陷可在侵入性提取胎儿组织后于宫内诊断。利用循环游离胎儿DNA的无创检测受限于较低的胎儿DNA比例。两种方法均需等到妊娠头三个月结束后才能进行。我们从妊娠5至19周非侵入性采集的巴氏涂片中分离出完整的滋养层细胞，用于胎儿DNA的下一代测序。对连续匹配的母体、胎盘和胎儿样本（n=20）通过多重靶向DNA测序对全部24条染色体上的59个短串联重复序列和94个单核苷酸变异位点进行了分析。数据显示胎儿DNA比例为85%至99.9%，胎儿单倍型分型准确率达100%……
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
