妊娠5周宫颈管滋养层细胞非侵入性分离后的胎儿基因组分析数据
该数据集来自 Dryad,发布于 2017 年,属于妊娠、分娩和产褥期分类。数据涉及从妊娠 5 至 19 周经 Papanicolaou 涂片非侵入性采集的完整滋养层细胞,用于胎儿 DNA 的新一代测序,并对连续配对的母体、胎盘和胎儿样本(n = 20)进行多重靶向 DNA 测序,覆盖 24 条染色

基本信息
资源简介
妊娠5周宫颈管滋养层细胞非侵入性分离后的胎儿基因组分析数据
Data from: Fetal genome profiling at 5 weeks of gestation after noninvasive isolation of trophoblast cells from the endocervical canal
该数据集来自 Dryad,发布于 2017 年,属于妊娠、分娩和产褥期分类。数据涉及从妊娠 5 至 19 周经 Papanicolaou 涂片非侵入性采集的完整滋养层细胞,用于胎儿 DNA 的新一代测序,并对连续配对的母体、胎盘和胎儿样本(n = 20)进行多重靶向 DNA 测序,覆盖 24 条染色体上的 59 个短串联重复和 94 个单核苷酸变异位点。可用于胎儿基因组分析、非侵入性产前检测相关研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2017。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):单基因突变导致超过 6000 种疾病、占所有儿科住院的 10% 以及婴儿死亡的 20%。唐氏综合征和其他非整倍体在全球超过 0.2% 的出生中发生,并因高龄生育而呈上升趋势。遗传来源的出生缺陷可在侵入性提取胎儿组织后在子宫内诊断。使用循环游离胎儿 DNA 的非侵入性检测受限于较低的胎儿 DNA 比例。这两种方式在妊娠头三个月结束前均不可用。我们从妊娠 5 至 19 周非侵入性采集的 Papanicolaou 涂片中分离出完整滋养层细胞,用于胎儿 DNA 的新一代测序。连续配对的母体、胎盘和胎儿样本(n = 20)通过多重靶向 DNA 测序进行了分析,覆盖所有 24 条 c
【主题与分类】
主题标签:genome profiling、noninvasive、trophoblast、TRIC。本站分类:妊娠、分娩和产褥期。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.43n2j
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.43n2j
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 6.81 GB。
数据说明
单基因突变导致了6000多种疾病,占所有儿科住院病例的10%,以及婴儿死亡的20%。唐氏综合征和其他非整倍体在全球出生人口中的发生率超过0.2%,且由于生育年龄推迟而呈上升趋势。遗传起源的出生缺陷可在侵入性提取胎儿组织后于宫内诊断。利用循环游离胎儿DNA进行的无创检测受限于较低的胎儿DNA比例。这两种方法均需等到妊娠早期末才能实施。我们从妊娠5至19周非侵入性采集的巴氏涂片中分离出完整的滋养层细胞,用于胎儿DNA的下一代测序。对连续配对的母体、胎盘和胎儿样本(n=20)进行了多重靶向DNA测序,覆盖全部24条染色体上的59个短串联重复序列和94个单核苷酸变异位点。数据显示胎儿DNA比例为85%至99.9%,胎儿单倍型分型准确率为100%。这一无创平台有望早在妊娠5周时即提供全面的胎儿基因组分析。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




