妊娠5周宫颈管滋养层细胞非侵入性分离后的胎儿基因组分析数据

该数据集来自 Dryad,发布于 2017 年,属于妊娠、分娩和产褥期分类。数据涉及从妊娠 5 至 19 周经 Papanicolaou 涂片非侵入性采集的完整滋养层细胞,用于胎儿 DNA 的新一代测序,并对连续配对的母体、胎盘和胎儿样本(n = 20)进行多重靶向 DNA 测序,覆盖 24 条染色

DryadDryad
dryad
浏览 6
基因组分类genome profilingnoninvasivetrophoblastTRIC
Data from: Fetal genome profiling at 5 weeks of gestation after noninvasive isolation of trophoblast cells from the endocervical canal

基本信息

模态
基因组
大小
6.809128879 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

妊娠5周宫颈管滋养层细胞非侵入性分离后的胎儿基因组分析数据

Data from: Fetal genome profiling at 5 weeks of gestation after noninvasive isolation of trophoblast cells from the endocervical canal

该数据集来自 Dryad,发布于 2017 年,属于妊娠、分娩和产褥期分类。数据涉及从妊娠 5 至 19 周经 Papanicolaou 涂片非侵入性采集的完整滋养层细胞,用于胎儿 DNA 的新一代测序,并对连续配对的母体、胎盘和胎儿样本(n = 20)进行多重靶向 DNA 测序,覆盖 24 条染色体上的 59 个短串联重复和 94 个单核苷酸变异位点。可用于胎儿基因组分析、非侵入性产前检测相关研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2017。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):单基因突变导致超过 6000 种疾病、占所有儿科住院的 10% 以及婴儿死亡的 20%。唐氏综合征和其他非整倍体在全球超过 0.2% 的出生中发生,并因高龄生育而呈上升趋势。遗传来源的出生缺陷可在侵入性提取胎儿组织后在子宫内诊断。使用循环游离胎儿 DNA 的非侵入性检测受限于较低的胎儿 DNA 比例。这两种方式在妊娠头三个月结束前均不可用。我们从妊娠 5 至 19 周非侵入性采集的 Papanicolaou 涂片中分离出完整滋养层细胞,用于胎儿 DNA 的新一代测序。连续配对的母体、胎盘和胎儿样本(n = 20)通过多重靶向 DNA 测序进行了分析,覆盖所有 24 条 c

【主题与分类】

主题标签:genome profiling、noninvasive、trophoblast、TRIC。本站分类:妊娠、分娩和产褥期。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.43n2j

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5061/dryad.43n2j

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 6.81 GB。

数据说明

单基因突变导致了6000多种疾病,占所有儿科住院病例的10%,以及婴儿死亡的20%。唐氏综合征和其他非整倍体在全球出生人口中的发生率超过0.2%,且由于生育年龄推迟而呈上升趋势。遗传起源的出生缺陷可在侵入性提取胎儿组织后于宫内诊断。利用循环游离胎儿DNA进行的无创检测受限于较低的胎儿DNA比例。这两种方法均需等到妊娠早期末才能实施。我们从妊娠5至19周非侵入性采集的巴氏涂片中分离出完整的滋养层细胞,用于胎儿DNA的下一代测序。对连续配对的母体、胎盘和胎儿样本(n=20)进行了多重靶向DNA测序,覆盖全部24条染色体上的59个短串联重复序列和94个单核苷酸变异位点。数据显示胎儿DNA比例为85%至99.9%,胎儿单倍型分型准确率为100%。这一无创平台有望早在妊娠5周时即提供全面的胎儿基因组分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。