多部位微生物组分析揭示不明原因复发性流产中卷曲乳杆菌富集：病例对照研究相关数据集

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源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23810458

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数据说明

本记录包含与文章摘要相关的原始数据。背景：与不明原因复发性妊娠丢失相关的微生物特征在各黏膜部位仍未完全明确。我们研究了19名患不明原因复发性妊娠丢失的非妊娠女性及18名既往妊娠成功的对照者阴道、子宫内膜、唾液和粪便样本中的分类组成及微生物功能潜力。样本采集于标准化的黄体中期窗口。鸟枪法宏基因组学用于表征阴道、唾液和粪便样本；子宫内膜样本主要通过16S rRNA基因扩增子测序进行分析。结果：两组间阴道分类组成存在差异，但α多样性无显著差异。以卷曲乳杆菌（Lactobacillus crispatus）为优势的菌群在复发性妊娠丢失女性中占63.2%，在对照者中占11.1%（调整比值比17.33，95%置信区间3.17至151.95）。在复发性妊娠丢失组内的探索性分析中，此类菌群出现在既往有两次或三次临床流产的13名女性中的12名，以及有四次或以上临床流产的6名女性中的0名。

阴道功能谱显示预测的糖酵解潜力富集（q = 0.026）。子宫内膜谱在探索性阈值下显示一致的L. crispatus富集（q = 0.12），配对的阴道和子宫内膜样本通常共享优势乳杆菌物种。对三名参与者的菌株水平分析显示参与者内部亲缘关系密切。唾液功能谱在组间存在差异，复发性妊娠丢失女性的嘌呤生物合成途径富集，而对照组的L-鸟氨酸生物合成富集（q < 0.05），尽管无显著分类学关联。未检测到显著的粪便分类学或功能差异。结论这些发现确定了与不明原因复发性妊娠丢失相关的区室特异性微生物关联，并且s

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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