CMTM4缺陷小鼠精子蛋白质组
该数据集来自 EBI 的 PXD013092，收录了 CMTM4 缺陷小鼠的精子蛋白质组数据。研究利用 CRISPR-Cas9 技术构建 Cmtm4 敲除小鼠，敲除雄鼠表现出男性不育，随后通过比较敲除鼠与野生型鼠的精子蛋白开展蛋白质组学分析
基本信息
资源简介
CMTM4缺陷小鼠精子蛋白质组
PXD013092 数据集收录了 CMTM4 缺陷小鼠的精子蛋白质组数据，来源为 EBI（ebi.ac.uk），在站内归类于泌尿生殖系统疾病 / 男性不育症方向。该研究利用 CRISPR-Cas9 技术构建了 Cmtm4 敲除小鼠，敲除雄鼠表现出男性不育，随后通过对敲除鼠与野生型鼠的精子蛋白进行比较，开展蛋白质组学分析，以刻画 CMTM4 缺失背景下精子蛋白组成的变化。数据集围绕精子、敲除、蛋白质组与 Cmtm4 等主题组织，物种信息指向小鼠（Mus musculus）。整体而言，该数据集为理解 CMTM4 与男性生殖能力之间的关系提供了蛋白质层面的数据基础，可供从事男性不育机制、精子生物学及蛋白质组学研究的用户参考使用。
【数据集背景】
男性不育症是泌尿生殖系统疾病中的重要类别，其成因涉及遗传、分子与蛋白质层面的多种因素。Cmtm4 基因在生殖过程中的作用受到关注：研究者通过 CRISPR-Cas9 技术构建了 Cmtm4 敲除小鼠模型，并观察到敲除雄鼠表现出男性不育表型。这一表型提示 CMTM4 的缺失可能影响精子发生或精子功能，而精子蛋白组成的变化可能是其中的关键环节。为在蛋白质层面寻找线索，研究进一步对敲除鼠与野生型鼠的精子蛋白进行比较分析，由此产生了本数据集。该数据集所属分类为泌尿生殖系统疾病 / 男性不育症，主题标签涵盖精子、敲除、蛋白质组与 Cmtm4，物种为小鼠。
【数据内容】
该数据集的核心内容是 CMTM4 缺陷小鼠的精子蛋白质组数据。研究以 Cmtm4 敲除小鼠与野生型小鼠为对象，对两者的精子蛋白进行比较，从而获得差异性的蛋白质组信息。数据集的主题标签包括 Sperm、Knockout、Proteome、Cmtm4，并包含物种注释信息，指向 Mus musculus（mouse）。除上述内容外，关于样本数量、蛋白鉴定数目、差异蛋白列表、定量结果等具体数据内容，源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源于 ebi.ac.uk，编号为 PXD013092，英文名称为“Sperm proteome of CMTM4-deficient mice”。其产生过程为：先以 CRISPR-Cas9 技术构建 Cmtm4 敲除小鼠，确认敲除雄鼠出现男性不育，再对敲除鼠与野生型鼠的精子蛋白进行蛋白质组学分析。除这些来源与实验背景信息外，关于具体的样本采集流程、蛋白提取方法、质谱平台、色谱条件、数据处理软件与参数等采集细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与男性不育症、精子生物学及蛋白质组学相关的研究场景。具体而言，可用于探讨 CMTM4 缺失对精子蛋白组成的影响，辅助识别与男性不育相关的候选蛋白或通路，也可作为精子蛋白质组研究中的比较数据参考。此外，对于关注 CRISPR-Cas9 敲除小鼠模型在生殖研究中的应用的用户，该数据集亦具备参考价值。除上述由数据集主题与背景直接支持的方向外，其他具体应用场景源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件格式说明、分析流程与复现步骤等。
【质量与限制】
源站未提供关于该数据集质量评估与使用限制的说明，例如样本量、数据完整性、技术偏差或适用范围等。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD013092
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Cmtm4基因敲除小鼠是通过CRISPR-Cas9技术构建的，该敲除小鼠表现出雄性不育。通过比较敲除小鼠与野生型小鼠，对精子蛋白质进行了蛋白质组学分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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