GenX相关分子特征与睾丸衰老及男性不育的多组学整合分析数据集
本数据集整合了人类睾丸衰老的单细胞RNA测序数据以及男性不育转录组数据,通过多组学分析方法鉴定了与GenX暴露相关的核心基因(SOD1、XRCC5、FOXO3、POLB),并利用分子对接和RT-qPCR验证了这些基因在男性不育诊断中的价值,主要应用于生殖毒理学和男性不育分子机制的研究,涉及转录组、单细胞测序等多模态数据。
基本信息
资源简介
本数据集围绕短链全氟和多氟烷基物质(PFAS)替代物GenX(HFPO-DA)的睾丸毒性展开研究。通过整合人类睾丸衰老的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据(GSE254315)以及男性不育转录组数据集(GSE45885/GSE45887),构建了GenX-衰老相关基因集,并利用LASSO回归与支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)方法鉴定了核心基因(SOD1、XRCC5、FOXO3、POLB)。这些基因在GenX暴露的大鼠睾丸组织中通过RT-qPCR验证,并进一步通过分子对接分析确认了GenX与蛋白的结合作用。数据集揭示了精子细胞具有最高的衰老敏感性,细胞间通讯逐渐下降,核心基因在男性不育中具有诊断价值,主要涉及FoxO信号通路、细胞衰老和DNA修复等机制。
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数据说明
本数据集围绕短链全氟和多氟烷基物质(PFAS)替代物GenX(HFPO-DA)的睾丸毒性展开研究。通过整合人类睾丸衰老的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据(GSE254315)以及男性不育转录组数据集(GSE45885/GSE45887),构建了GenX-衰老相关基因集,并利用LASSO回归与支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)方法鉴定了核心基因(SOD1、XRCC5、FOXO3、POLB)。这些基因在GenX暴露的大鼠睾丸组织中通过RT-qPCR验证,并进一步通过分子对接分析确认了GenX与蛋白的结合作用。数据集揭示了精子细胞具有最高的衰老敏感性,细胞间通讯逐渐下降,核心基因在男性不育中具有诊断价值,主要涉及FoxO信号通路、细胞衰老和DNA修复等机制。
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