GenX相关分子特征与睾丸衰老及男性不育的交集:多组学整合分析数据集

该数据集整合了人类睾丸衰老的单细胞RNA测序数据和男性不育的转录组数据,通过多组学分析鉴定了与GenX暴露相关的枢纽基因(SOD1、XRCC5、FOXO3、POLB),并利用分子对接和实验验证揭示了氧化应激与基因组维护在生殖毒性中的关键作用,主要应用于生殖毒理学和男性不育分子机制研究。

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2026-03-09 更新
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GenXtesticular agingmale infertilitysingle-cell RNA sequencingmachine learningmolecular dockingmolecular dynamics simulation
GenX-associated molecular signatures overlap with testicular aging and male infertility: a multi-omics integration analysis

基本信息

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0.000177749 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-03-09
版本
v1

资源简介

GenX相关分子特征与睾丸衰老及男性不育的交集:多组学整合分析数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《GenX-associated molecular signatures overlap with testicular aging and male infertility: a multi-omics integration analysis》。配套论文《GenX-associated molecular signatures overlap with testicular aging and male infertility: a multi-omics integration analysis》发表于 Journal of Environmental Science and Health, Part A(2026),DOI:10.1080/10934529.2026.2640332。项目资助方:This work was supported by Beijing Natural Science Foundation (7254520), National Natural Science Foundation of China (82505601), Postdoctoral Fellowship Program and China Postdoctoral Science Foundation (GZB20250910, 2025T181076, 2025M784009), Natural Science Foundation of Ningxia (2024AAC03715), Young Elite Scientists Sponsorship Program by China Association of Science and Technology (No. YESS20240193), Young Talents Support Program of the China Association of Chinese Medicine (CACM-2024-QNRC2-B17), and High-Level Key Discipline Construction Project of Traditional Chinese Medicine by the National Administration of Traditional Chinese Medicine (zyyzdxk-2023238).。源站首次发布:2026-03-09。

【数据内容】

源站原始描述:GenX (HFPO-DA), a short-chain per- and polyfluoroalkyl substance (PFAS) substitute, is implicated in testicular toxicity. GenX-related genes were intersected with aging-associated genes to construct a GenX-Aging gene set. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data from human testicular aging (GSE254315) were analyzed to evaluate cell-type-specific aging sensitivity and intercellular communication dynamics. Male infertility transcriptomic datasets (GSE45885/GSE45887) were integrated, and least a…

【数据结构与技术规格】

文件数 10 个,合计 177.75 KB。Supplementary Figure S1.pdf:application/pdf,47.32 KB。Supplementary Table S1.docx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document,16.85 KB。Supplementary Table S2.xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,10.08 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.31568890.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology。主题标签:GenX、testicular aging、male infertility、single-cell RNA sequencing、machine learning、molecular docking、molecular dynamics simulation。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology。

【获取与许可】

源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/GenX-associated_molecular_signatures_overlap_with_testicular_aging_and_male_infertility_a_multi-omics_integration_analysis/31568890

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:GenX-associated molecular signatures overlap with testicular aging and male infertility: a multi-omics integration analysis. Taylor & Francis. Gong, Zhuozhi; Feng, Qiujian; Tang, Siyuan; Chen, Wenyu; Liu, Shengjing

【使用注意】

· 源站最后修改于 2026-03-17,引用时请注意版本时效。

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数据集获取(Figshare)

源站:https://figshare.com/articles/dataset/GenX-associated_molecular_signatures_overlap_with_testicular_aging_and_male_infertility_a_multi-omics_integration_analysis/31568890

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数据说明

该数据集聚焦GenX(一种短链全氟和多氟烷基物质替代物)的睾丸毒性研究,通过整合多组学数据探索其与睾丸衰老及男性不育的关联。数据集包含人类睾丸衰老的单细胞RNA测序数据(GSE254315)以及男性不育的转录组数据集(GSE45885/GSE45887),并利用LASSO回归和支持向量机递归特征消除等方法鉴定了关键枢纽基因(SOD1、XRCC5、FOXO3、POLB)。研究揭示了精子细胞具有最高的衰老敏感性,细胞间通讯逐渐下降,并通过RT-qPCR在GenX暴露的大鼠睾丸组织中验证了基因表达变化。功能富集分析表明FoxO信号通路、细胞衰老和DNA修复通路参与其中,分子对接确认了GenX与蛋白质的良好结合。该数据集主要用于生殖毒理学和男性不育分子诊断研究,为GenX诱导的生殖毒性提供了候选生物标志物和机制见解。

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