数据集:子宫内膜蜕膜化关键基因启动子区H3K27ac与H3K27me3的相互变化

该数据集来自 Dryad,包含原代子宫内膜基质细胞(ESCs)及体外蜕膜化细胞的转录组与表观基因组图谱。细胞分为未处理(D0)、蜕膜化4天(D4)和8天(D8)三组,处理条件为8-bromo-cAMP与孕酮

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基因组分类epigenomeDNA methylationEndometriumHomo Sapienshistone modificationsdecidualization
Data from: Reciprocal changes of H3K27ac and H3K27me3 at the promoter regions of the critical genes for endometrial decidualization

基本信息

模态
基因组
大小
6.672929697 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

数据集:子宫内膜蜕膜化关键基因启动子区H3K27ac与H3K27me3的相互变化

Data from: Reciprocal changes of H3K27ac and H3K27me3 at the promoter regions of the critical genes for endometrial decidualization

该数据集来自 Dryad,包含原代子宫内膜基质细胞(ESCs)及体外蜕膜化细胞的转录组与表观基因组图谱。细胞分为未处理(D0)、蜕膜化4天(D4)和8天(D8)三组,处理条件为8-bromo-cAMP与孕酮。研究检测了DNA甲基化、H3K27ac、H3K9me3和H3K27me3等表观修饰,发现H3K27ac模式变化最显著,并与基因表达变化中度相关。蜕膜化中上调和下调的基因子集在启动子区呈现H3K27ac与H3K27me3的相互变化,且富集WNT4、ZBTB16、PROK1和GREB1等蜕膜化关键基因。数据可用于研究蜕膜化的表观调控机制及不孕症相关基因调控(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 U。

【数据集背景】

源站首次发布:2019。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:蜕膜化对于胚胎着床和胎盘发育至关重要。我们旨在获取原代子宫内膜基质细胞(ESCs)和体外蜕膜化细胞的转录组和表观基因组图谱。材料与方法:从人子宫内膜组织中分离的ESCs保持未处理(D0),或在8-bromo-cAMP和孕酮存在下蜕膜化4天(D4)和8天(D8)。结果:在所检测的表观遗传修饰(DNA甲基化、H3K27ac、H3K9me3和H3K27me3)中,蜕膜化过程中H3K27ac模式变化最为显著,并与基因表达变化呈中度相关。蜕膜化过程中上调和下调的基因子集与其启动子区H3K27ac和H3K27me3修饰的相互变化相关,并富集了蜕膜化所必需的基因,如WNT4、ZBTB16、PROK1和GREB1。

【主题与分类】

主题标签:epigenome、DNA methylation、Endometrium、Homo Sapiens、histone modifications、decidualization。本站分类:泌尿生殖系统疾病/不孕症。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.97s68c2

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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数据集获取

源站:https://doi.org/10.5061/dryad.97s68c2

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 6.67 GB。

数据说明

目的:蜕膜化对于胚胎着床和胎盘发育至关重要。我们旨在获取原代子宫内膜基质细胞(ESCs)及体外蜕膜化细胞的转录组和表观基因组图谱。材料与方法:从人子宫内膜组织中分离的ESCs保持未处理(D0),或在8-溴-cAMP和孕酮存在下蜕膜化4天(D4)和8天(D8)。结果:在所检测的表观遗传修饰(DNA甲基化、H3K27ac、H3K9me3和H3K27me3)中,H3K27ac模式变化最为显著,且与蜕膜化过程中的基因表达变化呈中度相关。蜕膜化过程中上调和下调的基因子集与其启动子区域H3K27ac和H3K27me3修饰的相互变化相关,并富集了蜕膜化所必需的基因,如WNT4、ZBTB16、PROK1和GREB1。结论:我们的数据集有助于进一步阐明蜕膜化的分子机制。

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