数据集:子宫内膜蜕膜化关键基因启动子区H3K27ac与H3K27me3的相互变化
该数据集来自 Dryad,包含原代子宫内膜基质细胞(ESCs)及体外蜕膜化细胞的转录组与表观基因组图谱。细胞分为未处理(D0)、蜕膜化4天(D4)和8天(D8)三组,处理条件为8-bromo-cAMP与孕酮

基本信息
资源简介
数据集:子宫内膜蜕膜化关键基因启动子区H3K27ac与H3K27me3的相互变化
Data from: Reciprocal changes of H3K27ac and H3K27me3 at the promoter regions of the critical genes for endometrial decidualization
该数据集来自 Dryad,包含原代子宫内膜基质细胞(ESCs)及体外蜕膜化细胞的转录组与表观基因组图谱。细胞分为未处理(D0)、蜕膜化4天(D4)和8天(D8)三组,处理条件为8-bromo-cAMP与孕酮。研究检测了DNA甲基化、H3K27ac、H3K9me3和H3K27me3等表观修饰,发现H3K27ac模式变化最显著,并与基因表达变化中度相关。蜕膜化中上调和下调的基因子集在启动子区呈现H3K27ac与H3K27me3的相互变化,且富集WNT4、ZBTB16、PROK1和GREB1等蜕膜化关键基因。数据可用于研究蜕膜化的表观调控机制及不孕症相关基因调控(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 U。
【数据集背景】
源站首次发布:2019。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:蜕膜化对于胚胎着床和胎盘发育至关重要。我们旨在获取原代子宫内膜基质细胞(ESCs)和体外蜕膜化细胞的转录组和表观基因组图谱。材料与方法:从人子宫内膜组织中分离的ESCs保持未处理(D0),或在8-bromo-cAMP和孕酮存在下蜕膜化4天(D4)和8天(D8)。结果:在所检测的表观遗传修饰(DNA甲基化、H3K27ac、H3K9me3和H3K27me3)中,蜕膜化过程中H3K27ac模式变化最为显著,并与基因表达变化呈中度相关。蜕膜化过程中上调和下调的基因子集与其启动子区H3K27ac和H3K27me3修饰的相互变化相关,并富集了蜕膜化所必需的基因,如WNT4、ZBTB16、PROK1和GREB1。
【主题与分类】
主题标签:epigenome、DNA methylation、Endometrium、Homo Sapiens、histone modifications、decidualization。本站分类:泌尿生殖系统疾病/不孕症。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.97s68c2
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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数据集获取
源站:https://doi.org/10.5061/dryad.97s68c2
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 6.67 GB。
数据说明
目的:蜕膜化对于胚胎着床和胎盘发育至关重要。我们旨在获取原代子宫内膜基质细胞(ESCs)及体外蜕膜化细胞的转录组和表观基因组图谱。材料与方法:从人子宫内膜组织中分离的ESCs保持未处理(D0),或在8-溴-cAMP和孕酮存在下蜕膜化4天(D4)和8天(D8)。结果:在所检测的表观遗传修饰(DNA甲基化、H3K27ac、H3K9me3和H3K27me3)中,H3K27ac模式变化最为显著,且与蜕膜化过程中的基因表达变化呈中度相关。蜕膜化过程中上调和下调的基因子集与其启动子区域H3K27ac和H3K27me3修饰的相互变化相关,并富集了蜕膜化所必需的基因,如WNT4、ZBTB16、PROK1和GREB1。结论:我们的数据集有助于进一步阐明蜕膜化的分子机制。
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