狩猎采集者与传统农民的口腔微生物组揭示与饮食相关的共生平衡与病原负荷变化

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A75f64f7671ff08aafb75a4724cb27e876e3d833387077a9696e5ea476a0dd649

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对现代饮食的不适应与多种慢性疾病有关。鉴于工业化社会中龋齿和慢性牙龈疾病等疾病的患病率较高，我们试图研究不同生存策略对口腔健康和生理的影响，并以口腔微生物组为记录依据。为控制环境和宿主遗传等混杂变量，我们从菲律宾三对居住地相近的狩猎采集者和传统农民群体中采集了唾液样本。唾液DNA的深度鸟枪法测序获得了高覆盖度的微生物组以及人类基因组。将这些微生物组与公开可得的西方饮食个体数据进行比较后发现，核心物种的丰度比与生存策略显著相关：狩猎采集者和西方人分别占据奈瑟菌属与嗜血杆菌属梯度的两端，而传统农民则处于……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。