Nanopore测序策略塑造乳腺癌队列肠道微生物组图谱：全长16S与鸟枪法宏基因组比较
该数据集来自乳腺癌队列的肠道微生物组研究，比较全长16S与鸟枪法宏基因组两种Nanopore测序策略对微生物组图谱的影响
基本信息
资源简介
Nanopore测序策略塑造乳腺癌队列肠道微生物组图谱：全长16S与鸟枪法宏基因组比较
Nanopore sequencing strategy shapes gut microbiome profiling: full-length 16S versus shotgun metagenomics in a breast cancer cohort
该数据集来自乳腺癌队列的肠道微生物组研究，比较全长16S与鸟枪法宏基因组两种Nanopore测序策略对微生物组图谱的影响。数据包含分类学丰度表、α与β多样性指标、分类器间相关性分析，以及基于ANCOM-BC2的结构零分析，可支撑论文全部图表与补充材料。原始数据存放于EBI BioProject PRJEB108219。该数据可用于评估测序策略差异、开展微生物组组成与多样性分析，以及乳腺癌相关肠道菌群研究的方法学比较（来源 DOI 解析，MIT License 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该存储库包含与手稿“Nanopore sequencing strategy shapes gut microbiome profiling: full-length 16S versus shotgun metagenomics in a breast cancer cohort”相关的源数据和补充表格。该数据集包括分类学丰度表、α和β多样性指标、分类器之间的相关性分析，以及使用ANCOM-BC2进行的结构零分析。这些数据支持手稿中呈现的所有图表和补充材料。原始数据可在EBI BioProject: PRJEB108219下获取。
【主题与分类】
主题标签：RNA, Ribosomal, 16S、Metagenomics、Whole Genome Sequencing、Microbiota、Nanopore Sequencing、Bioinformatics。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.18187123
使用许可：MIT License。
下载信息
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源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.18187123
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
该仓库包含与手稿《Nanopore测序策略影响肠道微生物组分析：乳腺癌队列中全长16S与鸟枪法宏基因组的比较》相关的源数据和补充表格。数据集包括分类学丰度表、α多样性和β多样性指标、分类器之间的相关性分析，以及使用ANCOM-BC2进行的结构性零分析。这些数据支持手稿中呈现的所有图表和补充材料。原始数据可在EBI BioProject：PRJEB108219下获取。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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