免疫相关基因与口腔溃疡的因果关联：基于汇总孟德尔随机化和全转录组关联分析的发现
该数据集包含通过孟德尔随机化（SMR）和全转录组关联分析（TWAS）方法研究口腔溃疡遗传基础所得到的基因表达数据，数据模态主要为基因表达定量性状位点（eQTL）数据和转录组关联统计结果，旨在识别与口腔溃疡发病机制相关的免疫相关因果基因（如CCR2、HLA-DRB1等），并探索其潜在的免疫调控通路，为口腔溃疡的遗传学研究、免疫机制解析和潜在治疗靶点发现提供数据支持。
https://figshare.com/articles/dataset/Causal_association_of_immune-related_genes_with_mouth_ulcers_findings_from_summary-based_Mendelian_randomization_and_transcriptome-wide_association_analysis/28930967
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资源简介
该数据集是一项针对口腔溃疡（人类最常见的溃疡性疾病）的遗传学研究数据集，旨在识别其发病机制中潜在的因果基因。数据集整合了来自GTEx和CAGE的eQTL数据，应用了汇总数据孟德尔随机化（SMR）和全转录组关联研究（TWAS）方法进行分析。分析结果包括SMR识别出的显著基因探针（如LRRC37A4P、CCR2等）以及TWAS识别出的显著基因（如IL12RB1、HLA-DRB1等）。功能富集分析揭示了免疫相关通路（特别是涉及HLA-DRB1和CCR2的通路）的强烈参与。该数据集为口腔溃疡的遗传基础提供了新的见解，并可能指向潜在的治疗靶点，主要应用于遗传学、免疫学和口腔疾病研究领域。
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