脑静脉血栓形成潜在生物标志物与治疗靶点识别数据集
该数据集整合了来自eQTLGen和PsychENCODE的外周血与脑组织表达数量性状位点数据,以及来自FinnGen的脑静脉血栓形成全基因组关联研究汇总统计数据,通过孟德尔随机化等遗传学分析方法,识别出IL18、BMPR2、COMT等与疾病易感性相关的候选基因,并利用单细胞测序、功能富集和分子对接技术分析了这些基因在免疫细胞中的表达模式、生物学功能及作为药物靶点的潜力,主要用于脑静脉血栓形成的致病机制探索、生物标志物发现和药物靶点识别研究。
https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Identification_of_potential_biomarkers_and_therapeutic_targets_for_cerebral_venous_thrombosis/29605464/1
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资源简介
该数据集是一个整合了多组学数据的生物医学研究数据集,专注于脑静脉血栓形成(CVT)这一罕见但危及生命的卒中亚型。数据集整合了来自eQTLGen(外周血)和PsychENCODE(脑组织)两个大规模表达数量性状位点数据集作为暴露因素,以及来自FinnGen的CVT全基因组关联研究(GWAS)汇总统计数据作为结果。通过两样本孟德尔随机化、敏感性分析、基于汇总数据的MR以及贝叶斯共定位等方法,识别出与CVT易感性相关的候选基因。数据集进一步包含了功能富集分析、单细胞RNA测序分析、药物预测和分子对接分析的结果,揭示了基因在细胞因子信号传导、细胞粘附和凝血途径中的功能,并定位了其在单核细胞、树突状细胞和自然杀伤细胞中的表达。该数据集主要用于识别CVT的潜在致病基因、生物标志物和药物靶点,为后续的机制研究和治疗开发提供遗传学依据。
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