GNPS 犬特应性皮炎脂质谱局部与全身变化潜在生物标志物数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/gnps/MSV000087837

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脂质在皮肤中发挥着关键作用，既是表皮屏障的组成部分，也是信号分子。犬特应性皮炎与皮肤脂质组成的变化相关，但这些变化是发生在皮炎发作之前，还是继发于皮炎，目前尚不清楚。我们应用快速脂质谱分析质谱方法对犬的皮肤和血液样本进行了分析，并确定了全身治疗后的变化。研究纳入了30只对照犬和30只患有轻度至中度皮炎的异位性皮炎犬。在对照犬、非病变皮肤和病变皮肤之间观察到了脂质谱的显著差异。此外，血液样本中的脂质组成也发生了显著改变，表明脂质代谢存在全身性变化。使用奥拉替尼或洛基维特单抗治疗可显著降低疾病的临床严重程度，并伴随皮肤和血液脂质的变化。一组皮肤脂质特征被选为生物标志物，可将样本分类为对照或异位性皮炎，准确率达95%，而血液脂质区分对照犬和异位性皮炎犬的准确率为82%。

这些数据表明，特应性皮炎是一种全身性疾病，并支持使用快速脂质谱分析来识别新的生物标志物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。