禽类血吸虫尾蚴穿透腺激光显微切割差异蛋白质组分析数据

主题标签:血吸虫尾蚴、穿透腺、蛋白质组学、LC-MS/MS、尾蚴性皮炎、宿主入侵。本数据集为皮肤疾病领域公开数据集,由Mendeley提供,主题涵盖血吸虫尾蚴。

MendeleyMendeley
datacite
浏览 4
医学影像血吸虫尾蚴穿透腺蛋白质组学LC-MS/MS尾蚴性皮炎宿主入侵
Differential proteomic analysis of laser-microdissected penetration glands of avian schistosome cercariae with a focus on proteins involved in host invasion

基本信息

模态
医学影像
大小
0.007103917 GB
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

禽类血吸虫尾蚴穿透腺激光显微切割差异蛋白质组分析数据

本数据集为一项蛋白质组学研究的数据附件,英文名称为“Differential proteomic analysis of laser-microdissected penetration glands of avian schistosome cercariae with a focus on proteins involved in host invasion”,由Libor Mikes提交,经Mendeley发布,发布时间为2022年。数据集围绕禽类血吸虫尾蚴穿透腺的差异蛋白质组分析展开,重点关注与宿主入侵相关的蛋白质,采用LC-MS/MS技术对两种分别分离的穿透腺类型中的蛋白质进行肽段鉴定与注释,并包含优化实验的结果。该数据与发表于《International Journal for Parasitology》2022年第52卷第6期第343至358页的论文相配套,以Creative Commons Attribution 4.0 International许可开放共享,在分类上归入皮肤疾病/其他类别,主题涵盖血吸虫尾蚴、穿透腺、蛋白质组学、LC-MS/MS、尾蚴性皮炎与宿主入侵等方向。

【数据集背景】

本数据集的科学背景涉及血吸虫的生活史与宿主入侵过程。血吸虫的侵入阶段即尾蚴,离开其中间宿主螺类后,穿透终末宿主的皮肤,并转变为血吸虫童虫,迁移至最终定居部位。在此入侵过程中,尾蚴的穿透腺发挥关键作用。本研究所针对的禽类寄生虫为Trichobilharzia szidati(吸虫纲:裂体科),其尾蚴可引起人类尾蚴性皮炎。数据集所配套的论文聚焦于对激光显微切割获得的穿透腺进行差异蛋白质组分析,以识别参与宿主入侵的蛋白质。源站描述在此处未完整给出,关于入侵过程的后续细节源站未提供。

【数据内容】

数据集主要包含基于LC-MS/MS分析所获得的肽段鉴定与注释表格,分析对象为感染性幼虫两种分别分离的穿透腺类型中所含的蛋白质。除肽段鉴定与注释外,数据中还呈现了优化实验的结果。数据以表格形式组织,属于论文的补充材料。关于表格的具体数量、字段结构、记录条数及文件格式,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于对禽类寄生虫Trichobilharzia szidati尾蚴穿透腺的激光显微切割,并对两种分别分离的穿透腺类型进行LC-MS/MS分析。数据由Libor Mikes提交,经Mendeley发布,来源站为doi.org,并与《International Journal for Parasitology》2022年第52卷第6期第343至358页的论文相配套,论文DOI为https://doi.org/10.1016/j.ijpara.2021.12.003。样本采集地点、实验批次、仪器型号与试剂信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与血吸虫尾蚴穿透腺及宿主入侵机制相关的蛋白质组学研究,可用于查阅两种穿透腺类型中蛋白质的肽段鉴定与注释结果,也可用于了解相关优化实验的结果。鉴于其主题涉及尾蚴性皮炎,该数据亦可作为皮肤疾病相关研究中的参考资料。关于数据在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

使用者可结合配套论文阅读本数据集中的肽段鉴定与注释表格,以理解两种穿透腺类型中蛋白质的鉴定结果及优化实验内容。数据以Creative Commons Attribution 4.0 International许可发布,使用时应遵循该许可的署名要求。关于数据的具体读取方式、软件依赖与分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

数据基于LC-MS/MS分析获得,包含肽段鉴定与注释以及优化实验结果,并作为同行评议论文的补充材料发布。关于数据的完整性、鉴定置信度阈值、假阳性率、重复次数及覆盖度等质量指标,源站未提供。数据仅针对Trichobilharzia szidati尾蚴的穿透腺,向其他物种或组织的外推需谨慎,相关验证信息源站未提供。

【引用与许可】

使用本数据集时应引用其配套论文:“Differential proteomic analysis of laser-microdissected penetration glands of avian schistosome cercariae with a focus on proteins involved in host invasion”,International Journal for Parasitology, 2022, vol. 52, issue 6, pp. 343-358,DOI为https://doi.org/10.1016/j.ijpara.2021.12.003。数据集作者为Libor Mikes,由Mendeley发布,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。关于具体引用格式与作者贡献信息,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.17632/c8stbpx5mz

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 7.1 MB。

数据说明

本数据为发表于《International Journal for Parasitology》2022年第52卷第6期第343-358页的文章《激光显微切割禽类血吸虫尾蚴穿透腺的差异蛋白质组学分析——聚焦于参与宿主入侵的蛋白质》(https://doi.org/10.1016/j.ijpara.2021.12.003)的补充数据。各表格主要包含基于LC-MS/MS分析的肽段鉴定与注释结果,分析对象为禽类寄生虫Trichobilharzia szidati(吸虫纲:裂体科)感染性幼虫两种分别分离的穿透腺中所含蛋白质,该寄生虫可引起人类尾蚴性皮炎。文中亦呈现了优化实验的结果。血吸虫入侵阶段——尾蚴——离开其中间宿主螺类,穿透终末宿主皮肤,并转化为童虫迁移至最终部位。入侵过程中,尾蚴利用特化全泌型分泌细胞——后吸盘穿透腺与环吸盘穿透腺——的溶组织性及其他生物活性产物,而这些腺体内容物的特征尚不充分。

本文呈现了迄今为止关于尾蚴穿刺腺蛋白表征与定位的最大数据集。我们首先优化了尾蚴体(头部)样本的处理方法。经茜素预染色、化学未固定的样本为质谱分析提供了最佳结果,并使得激光显微切割能够区分PA腺和CA腺。5种催化类型的肽酶分别占腹吸盘后腺和腹吸盘周围腺中可靠鉴定蛋白的约8%和6%。主要腺内切肽酶为invadolysin、nardilysin、组织蛋白酶B2和L3,以及弹性蛋白酶2b直系同源物。两种胱抑素和一种丝氨酸蛋白酶抑制剂是腺体中高丰度的肽酶抑制剂。腹吸盘后腺通常具有丰富的酶装备,而腹吸盘周围腺则显著富含 venom allergen 样蛋白(PF00

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案